Questa è l'app di Windows denominata Covidex la cui ultima versione può essere scaricata come Covidex_2021_11_27.rar. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app denominata Covidex con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avvia qualsiasi emulatore online OS OnWorks da questo sito Web, ma migliore emulatore online Windows.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Windows che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione e installala.
- 7. Scarica Wine dai repository software delle tue distribuzioni Linux. Una volta installato, puoi quindi fare doppio clic sull'app per eseguirli con Wine. Puoi anche provare PlayOnLinux, un'interfaccia fantasiosa su Wine che ti aiuterà a installare programmi e giochi Windows popolari.
Wine è un modo per eseguire il software Windows su Linux, ma senza Windows richiesto. Wine è un livello di compatibilità Windows open source in grado di eseguire programmi Windows direttamente su qualsiasi desktop Linux. Essenzialmente, Wine sta cercando di re-implementare abbastanza Windows da zero in modo che possa eseguire tutte quelle applicazioni Windows senza effettivamente bisogno di Windows.
IMMAGINI
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covidex
DESCRIZIONE
I sottotipi o cladi virali rappresentano cluster tra gli isolati della popolazione globale di una specie definita. La sottotipizzazione è rilevante per gli studi sull'epidemiologia, l'evoluzione e la patogenesi dei virus. In questo senso, Covidex è stato sviluppato come strumento di sottotipizzazione di machine learning open source senza allineamento. È un'app brillante che consente una classificazione rapida e accurata dei genomi virali in cluster predefiniti. Se vengono caricate più di 1000 sequenze, lo strumento verrà eseguito in modalità multithread. In grado di classificare 16000 sequenze genomiche in meno di un minuto (processore AMD Ryzen 7 1700 8-core 3 GHz)
Per una versione dell'app basata sul Web (solo per piccoli set di dati: 100 seq max) vai a
http://covidex.unlu.edu.ar
Se usi Covidex, considera di citare la seguente prestampa:
https://biorxiv.org/cgi/content/short/2020.08.21.261347v1
Se pensi che il mio lavoro sia utile puoi offrirmi un caffè! https://www.buymeacoffee.com/mcacciabue
Caratteristiche
- Sottotipizzazione di sequenze
- Interfaccia user-friendly
- Grafici riassuntivi
- Versione portatile per Windows (nessuna installazione necessaria)
- Modalità multithread
Pubblico
Scienza/Ricerca, Utenti finali/Desktop
Linguaggio di programmazione
R
Questa è un'applicazione che può essere scaricata anche da https://sourceforge.net/projects/covidex/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
