Questa è l'app Windows denominata MANTI.pl / muda.pl, eseguibile online su Windows tramite Linux. L'ultima versione può essere scaricata come muda.pl-v3.6.zip. Può essere eseguita online sul provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app denominata MANTI.pl / muda.pl per eseguirla su Windows online o su Linux online con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avvia qualsiasi emulatore online OS OnWorks da questo sito Web, ma migliore emulatore online Windows.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Windows che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione e installala.
- 7. Scarica Wine dai repository software delle tue distribuzioni Linux. Una volta installato, puoi quindi fare doppio clic sull'app per eseguirli con Wine. Puoi anche provare PlayOnLinux, un'interfaccia fantasiosa su Wine che ti aiuterà a installare programmi e giochi Windows popolari.
Wine è un modo per eseguire il software Windows su Linux, ma senza Windows richiesto. Wine è un livello di compatibilità Windows open source in grado di eseguire programmi Windows direttamente su qualsiasi desktop Linux. Essenzialmente, Wine sta cercando di re-implementare abbastanza Windows da zero in modo che possa eseguire tutte quelle applicazioni Windows senza effettivamente bisogno di Windows.
IMMAGINI
Ad
MANTI.pl / muda.pl per funzionare su Windows online anziché su Linux online
DESCRIZIONE
-------- ATTENZIONE INIZIO: RINOMINAmuda.pl è stato rinominato in MANTI.pl con v3.7, lo sviluppo del progetto può essere seguito nella pagina del progetto MANTI su sourceforge.net. Le vecchie versioni rimangono qui per scopi d'archivio.
-------- ATTENZIONE FINE
muda.pl è uno script di valutazione (scritto in Perl) senza grandi dipendenze.
Riunisce le informazioni da 4 diversi file di output MaxQuant in un file principale adatto esplicitamente per le analisi neo-termini delle proteine. L'ancora centrale per la congregazione dei dati è il file modificationSpecificPeptides.txt - i dati aggiuntivi sono dedotti da diversi altri file di origine dalla cartella txt di MaxQuant ma il punto di partenza per l'assemblaggio dei dati è esclusivamente il file modificationSpecificPeptides.txt. Forse utile anche per i normali scopi di proteomica, ma questo script è fortemente ottimizzato per l'identificazione e la convalida di proteine neo-termini.
Per una spiegazione più approfondita dei parametri dello script e della strategia di valutazione, consultare l'ampio manuale PDF.
Caratteristiche
- Valutazione dei dati MaxQuant
- Identificazione e convalida di Protein-Termini
- Annotazione e assemblaggio dei dati UniProt
- Rimappatura di Termini identificati in Isoforme
- Integrazione Limma, LOCALIZER e TopFINDer
- Ben documentato
Pubblico
Scienza / Ricerca
Interfaccia utente
Riga di comando
Linguaggio di programmazione
Perl
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/muda/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online in modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
