Questa è l'app di Windows denominata misc genomics tools la cui ultima versione può essere scaricata come misc_genomics_tools_v0.2.zip. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app denominata strumenti di genomica misc con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avvia qualsiasi emulatore online OS OnWorks da questo sito Web, ma migliore emulatore online Windows.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Windows che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione e installala.
- 7. Scarica Wine dai repository software delle tue distribuzioni Linux. Una volta installato, puoi quindi fare doppio clic sull'app per eseguirli con Wine. Puoi anche provare PlayOnLinux, un'interfaccia fantasiosa su Wine che ti aiuterà a installare programmi e giochi Windows popolari.
Wine è un modo per eseguire il software Windows su Linux, ma senza Windows richiesto. Wine è un livello di compatibilità Windows open source in grado di eseguire programmi Windows direttamente su qualsiasi desktop Linux. Essenzialmente, Wine sta cercando di re-implementare abbastanza Windows da zero in modo che possa eseguire tutte quelle applicazioni Windows senza effettivamente bisogno di Windows.
IMMAGINI
Ad
vari strumenti di genomica
DESCRIZIONE
Questa è una raccolta di vari programmi sviluppati nel corso di un progetto di genomica, che coinvolge il ceppo Pseudomonas NCIMB10586
Questi includono
* identificare e correggere gli errori in una sequenza del genoma (ad es.) di pacbio utilizzando letture illumina
* Sequenza procariotica/annotazione del genoma
* Analisi RNAseq - normalizzazione e confronto di più campioni come gruppo
* Visualizzazione RNAseq
Tutti gli script vengono forniti sulla base del "migliore sforzo", tuttavia, a causa di varie modifiche al sistema, non garantisco che tutti i file siano la versione utilizzata nell'analisi.
Inoltre, tieni presente che questi sono stati sviluppati tenendo conto dell'opportunità, ovvero che il processo doveva essere eseguito nella sua forma finale una volta; è stata prestata poca attenzione all'ottimizzazione del runtime o al concatenamento di script e talvolta si accede manualmente alle risorse esterne.
Caratteristiche
- Correzione degli errori di sequenza del genoma
- Annotazione della sequenza procariotica
- Normalizzazione RNAseq di più campioni come gruppo
- Visualizzazione di serie di campioni RNAseq/corso temporale
Pubblico
Scienza / Ricerca
Linguaggio di programmazione
Perl
Categorie
Questa è un'applicazione che può essere scaricata anche da https://sourceforge.net/projects/misc-genomics-tools/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri Sistemi Operativi gratuiti.
