Questa è l'app per Windows denominata NOFI Ranking, eseguibile online su Windows anziché su Linux. La sua ultima versione può essere scaricata come NOFI-ranking_v1.zip. Può essere eseguita online sul provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app denominata NOFI ranking per eseguirla su Windows online o su Linux online con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avvia qualsiasi emulatore online OS OnWorks da questo sito Web, ma migliore emulatore online Windows.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Windows che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione e installala.
- 7. Scarica Wine dai repository software delle tue distribuzioni Linux. Una volta installato, puoi quindi fare doppio clic sull'app per eseguirli con Wine. Puoi anche provare PlayOnLinux, un'interfaccia fantasiosa su Wine che ti aiuterà a installare programmi e giochi Windows popolari.
Wine è un modo per eseguire il software Windows su Linux, ma senza Windows richiesto. Wine è un livello di compatibilità Windows open source in grado di eseguire programmi Windows direttamente su qualsiasi desktop Linux. Essenzialmente, Wine sta cercando di re-implementare abbastanza Windows da zero in modo che possa eseguire tutte quelle applicazioni Windows senza effettivamente bisogno di Windows.
La classifica NOFI verrà eseguita su Windows online anziché su Linux online
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DESCRIZIONE
L'algoritmo di classificazione NOFI è stato sviluppato per assegnare una bassa priorità agli ioni frammento interessati dall'interferenza. L'implementazione è uno script R personalizzabile. Una versione futura conterrà una versione modulare. Lo schema è il seguente:1) L'input contiene l'elenco degli ioni frammento SWATH XIC provenienti dai peptidi identificati e quantificati da strumenti software quali Skyline e OpenSWATH.
2) Il primo passaggio in NOFI è il calcolo dei 4 attributi (RTd, FWHMd, IRd e IRrep) utilizzati per rappresentare ogni frammento di ione come vettore.
3) Vengono utilizzate tecniche di rilevamento multivariato dei valori anomali per classificare tutti gli ioni frammento di ciascun peptide.
4) Vengono generate diverse figure (un file pdf) per visualizzare l'effetto degli ioni frammento Top-N su diversi indicatori.
5) L'utente può scegliere il numero di ioni frammento superiore per peptide, utilizzando così il sottoinsieme ottimale di NOFI Top-N ad alta priorità per la quantificazione, escludendo al contempo gli ioni frammento danneggiati.
Pubblico
Scienza / Ricerca
Linguaggio di programmazione
B / R
Questa applicazione può essere scaricata anche da https://sourceforge.net/projects/nofiranking/. È ospitata su OnWorks per poter essere eseguita online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
