Questa è l'app di Windows denominata Scaffold_Builder la cui ultima versione può essere scaricata come scaffold_builder_v2.2.zip. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app chiamata Scaffold_Builder con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avvia qualsiasi emulatore online OS OnWorks da questo sito Web, ma migliore emulatore online Windows.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Windows che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione e installala.
- 7. Scarica Wine dai repository software delle tue distribuzioni Linux. Una volta installato, puoi quindi fare doppio clic sull'app per eseguirli con Wine. Puoi anche provare PlayOnLinux, un'interfaccia fantasiosa su Wine che ti aiuterà a installare programmi e giochi Windows popolari.
Wine è un modo per eseguire il software Windows su Linux, ma senza Windows richiesto. Wine è un livello di compatibilità Windows open source in grado di eseguire programmi Windows direttamente su qualsiasi desktop Linux. Essenzialmente, Wine sta cercando di re-implementare abbastanza Windows da zero in modo che possa eseguire tutte quelle applicazioni Windows senza effettivamente bisogno di Windows.
IMMAGINI
Ad
Impalcatura_Builder
DESCRIZIONE
Scaffold_builder è un software per ordinare i contigs generati dal sequenziamento delle bozze lungo una sequenza di riferimento. Le lacune sono riempite con N e piccole sovrapposizioni sono allineate con l'algoritmo di Needleman-Wunsch e il consenso creato con i codici IUPAC. Scaffold_builder può aiutare nell'assemblaggio e nell'annotazione dei genomi rivelando ciò che manca e consentendo un sequenziamento mirato per colmare tali lacune.(c) Silva GG, Dutilh BE, Matthews TD, Elkins K, Schmieder R, Dinsdale EA, Edwards RA.
Si prega di citare: "Combinazione de novo e assemblaggio guidato da riferimenti con Scaffold_builder", Codice sorgente per Biologia e Medicina 2013.
Caratteristiche
- ponteggio
- bozza di genoma
- bioinformatica
Interfaccia utente
Basato sul Web, riga di comando
Linguaggio di programmazione
Python
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/scaffold-b/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
