זהו הפקודה checktranse שניתן להפעיל בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
checktrans - מדווח על קודוני STOP וסטטיסטיקות ORF של חלבון
תַקצִיר
checktrans -סדר פעולות המשך -orfml מספר שלם [-הוספה בוליאני] -תיק אוסף
-outseq ההמשך -תבוסה הישג
checktrans עזרה
תיאור
checktrans היא תוכנית שורת פקודה מבית EMBOSS ("האירופה מולקולרית ביולוגיה פתוחה
חבילת תוכנה"). זה חלק מהפקודה "גרעין: מציאת גנים, גרעין: תרגום".
קבוצות.
אפשרויות
קֶלֶט סעיף
-סדר פעולות המשך
דרוש סעיף
-orfml מספר שלם
ערך ברירת מחדל: 100
נוסף סעיף
-הוספה בוליאני
כוכבית ברצף החלבון מציינת את מיקומו של קודון STOP. Checktrans
מניח שכל ה-ORF מסתיימים בקודון STOP. אילוץ את הרצף להסתיים ב-an
כוכבית, אם אין כבר אחת שם, גורמת ל-checktrans להתייחס לסוף כאל א
ORF פוטנציאלי. אם נוספה כוכבית, היא לא נכללת בספירה המדווחת של
עצירות. ערך ברירת מחדל: Y
תְפוּקָה סעיף
-תיק אוסף
-outseq ההמשך
קובץ רצף לאחסון רצפי ORF של פלט
-תבוסה הישג
קובץ עבור תכונות פלט
השתמש ב-checktranse באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net
