זהו הפקודה exonpairs שניתן להפעיל בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
exonpairs - מודול SNAP exonpairs
תַקצִיר
exonpairs [אפשרויות]HMM פילה>פאסטה פילה> [אפשרויות]
אפשרויות
-min-intron
אורך אינטרון מינימלי [30]
-max-intron
אורך אינטרון מרבי [10000]
-einit-אורך
אורך עינת מינימלי ב-bp [10]
-eterm-אורך
אורך Eterm מינימלי ב-bp [10]
-אורך אקסון
אורך אקסון מינימלי ב-bp [30]
-intron-ציון ציון אינטרון מינימלי בסיביות [-5]
-einit-score
ציון עינת מינימלי בסיביות [-5]
-eterm-score
ציון Eterm מינימום בסיביות [-5]
-ציון אקסון
ציון אקסון מינימלי בסיביות [-5]
-ציון-זוג
ציון זוג מינימלי (אקסון-אינטררון-אקסון) [10]
-באורך האגף
אורך הרצף האגף לכל אקסון [20]
-lcmask
התייחס לאותיות קטנות כאל N
השתמש ב-exonpairs באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net
