gt-eval - מקוון בענן

תָכְנִית:

שֵׁם

gt-eval - השווה קובצי הערות והצג מדדי דיוק (תחזית לעומת הפניה).

תַקצִיר

gt הערכה reference_file prediction_file

תיאור

-נוק [כן|לא]
להעריך את רמת הנוקלאוטיד (צריכת הזיכרון היא פרופורציונלית לגדלי קבצי הקלט)
(ברירת מחדל: כן)

-ltr [כן|לא]
להעריך חיזוי רטרוטרנספוזון LTR במקום חיזוי גנים (הכל
רכיבי LTR_retrotransposon נחשבים כבעלי גדיל לא מוגדר) (ברירת מחדל:
לא)

-לטרדלתא [ערך]
הגדר דלתא מותרת כדי שגבולות LTR ייחשבו שווים (ברירת מחדל: 20)

-v [כן|לא]
להיות מילולי (ברירת מחדל: לא)

-o [שם הקובץ]
הפנה פלט לקובץ שצוין (ברירת מחדל: לא מוגדר)

-gzip [כן|לא]
כתוב קובץ פלט דחוס של gzip (ברירת מחדל: לא)

-bzip2 [כן|לא]
כתוב קובץ פלט דחוס bzip2 (ברירת מחדל: לא)

כוח [כן|לא]
לכפות כתיבה לקובץ פלט (ברירת מחדל: לא)

עזרה
הצג עזרה וצא

-הפך
להציג מידע על הגרסה ולצאת

התוכנית מציגה ערכי רגישות וסגוליות עבור סוגי תכונה מסוימים (למשל,
גן, mRNA ואקסון). עבור סוגי תכונה מסוימים, מספר התכונות החסרות והשגויות של
הסוג הזה מוצג גם. לפיכך, "חסר" פירושו מספר התכונות מהסוג הזה
ה"הפניה" ללא חפיפה לתכונה מסוג זה מה"תחזית". סְגָן
להיפך, "לא נכון" מציין את מספר התכונות מהסוג הזה מה"תחזית" ללא
חפיפה לתכונה מסוג זה מה"הפניה".

דיווח באגים

דווח על באגים ל[מוגן בדוא"ל]>.

השתמש ב-gt-eval באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net