קלט - מקוון בענן

תָכְנִית:

שֵׁם

קלט - מאתחל קבצים לפני הפעלת Psi

תיאור

התכנית קלט היא תוכנית ראשונית הקוראת את נתוני הקלט עבור המולקולה
(גיאומטריה, ערכת בסיס וכו') ומייצר קובץ עבודה שנקרא שהוא האמיתי
נקודת ההתחלה של כל חישוב. ה קלט התוכנית יכולה להתמודד עם סך של 100 אטומים ו
1500 פונקציות גאוסיות פרימיטיביות ייחודיות. ה קלט התוכנית מגבילה את השימוש בסימטריה
הצבע קבוצות על D2h ותתי הקבוצות שלו.

ביבליוגרפיה

עבור ערכות בסיס STO:

1. WJ Hehre, RF Stewart ו-JA Pople, J. Chem. פיזי. 51 (1969) 2657.

2. WJ Hehre, R. Ditchfield, RF Stewart ו-JA Pople, J. Chem. פיזי. 52 (1970)
2769.

עבור DZ ומערכות הבסיס הישנות של TZ:

1. S. Huzinaga, J. Chem. פיזי. 42 (1965) 1293.

2. TH Dunning, J. Chem. פיזי. 53 (1970) 2823.

עבור ערכות בסיס DZP:
ללי ולהיות;

1. AJ Thakkar, T. Koga, M. Saito, RE Hoffmayer, Inter. J. Quant. Chem. סימן 27
(1993) 343.

עבור Na ו-Mg;

1. S. Huzinaga, Approximate Atomic Wavefunction II, Dept. of Chem. דו"ח, אוניב. שֶׁל
אלברטה, אדמונטון, אלברטה, קנדה, 1971.

עבור ערכות בסיס רידברג ויונים שליליים:

1. TH Dunning, Jr. ו-PJ Hay, ב-Modern Theoretical Chemistry, Volume 3, Ed. ח.
F. Schaefer III, Plenum Press, NY, 1977.

עבור ערכות הבסיס החדשות של TZ:

1. TH Dunning, J. Chem. פיזי. 55, (1971) 716.

2. AD McLean ו-GS Chandler, J. Chem. Phys., 72 (1980) 5639.

עבור ערכות הבסיס החוזי הכללי:

1. TH Dunning Jr., J. Chem. פיזי. 90, (1989).

2. FB van Duijneveldt, IBM Res. נציג RJ 945 (1971).

עבור ערכות הבסיס של Wachters:

1. AJH Wachters, J. Chem. פיזי. 52, (1970) 1033.

עבור ערכות הבסיס cc-pVXZ (X=D,T,Q) למימן ול-
אטומי שורה ראשונה B-Ne:

1. TH Dunning, Jr., J. Chem. פיזי. 90, 1007 (1989).

עבור ערכות הבסיס של aug-cc-pVXZ (X=D,T,Q) עבור H ו-B-Ne:

1. RA Kendall, TH Dunning, Jr., ו-RJ Harrison, J. Chem. פיזי. 96, 6796
(1992).

עבור ערכות cc-pVXZ ו- aug-cc-pVXZ (X=D,T,Q) עבור
אטומי השורה השנייה אל-אר:

1. DE Woon ו-TH Dunning, Jr., J. Chem. פיזי. 98, 1358 (1993).

עבור ערכות הבסיס cc-pVXZ (X=D,T,Q) עבור הליום; cc-pV5Z ו
ערכות בסיס aug-cc-pV5Z עבור H, B-Ne ו-Al-Ar:

1. DE Woon, KA Peterson, ו-TH Dunning, Jr. (לא פורסם).

עבור ערכות הבסיס cc-pVXZ ו- aug-cc-pVXZ (X=D,T,Q) עבור
ליתיום, בריליום ונתרן; cc-pV5Z ו- aug-cc-pV5Z
ערכות בסיס עבור בריליום:

1. DE Woon ו-TH Dunning, Jr. (לא פורסם).

ראה גם

1. R. Poirier, R. Kari ו-IG Csizmadia, "Handbook of Gaussian Basic Sets" Phys.
Sci. נתונים 24 (Elsevier, 1985), והפניות בהם.

קלט פורמט

בנוסף לאפשרויות שורת הפקודה הסטנדרטיות הנתמכות על ידי כל מודולי Psi 3, ה
הארגומנטים הבאים של שורת הפקודה זמינים:

--keep_chkpt
אפשרות זו תגרום לקלט לשמור את קובץ המחסום ואולי לדרוס את
מֵידָע. כברירת מחדל, קלט ימחק את קובץ המחסום ויצור קובץ חדש
אחד.

--chkptgeom
אפשרות זו תגרום לקלט לקרוא את הגיאומטריה מקובץ המחסום במקום
מקובץ הקלט.

--chkptmos
אפשרות זו תגרום קלט לנסות לשחזר אורביטלים מולקולריים מקודם
חישוב מאוחסן בקובץ המחסום. אם יימצאו, MOs תפוסים יהיו
מוקרן על הבסיס החדש. המרחב הוירטואלי מתמלא על ידי ה-MOs הוירטואליים
מתקבל על ידי אלכסון של המילטון הליבה (גם אם הבסיס החדש והישן נקבע
זהים). זה לא ישפיע על הליך SCF הבא בשום צורה, אבל
צריך לזכור.

--noproject
אפשרות זו תמנע הקרנה של MOs על הבסיס החדש. שימושי ב
שילוב עם האפשרות הקודמת.

--noreorient
אפשרות זו תמנע את הכיוון מחדש של המולקולה לאינרציה הייחוס
מסגרת לפני קביעת קבוצת הנקודות.

--nocomshift
אפשרות זו תמנע מעבר של מרכז המסה של המולקולה למקור
לפני קביעת קבוצת הנקודות.

--savemos
אפשרות זו תגרום קלט לנסות לשחזר אורביטלים מולקולריים מקודם
חישוב מאוחסן בקובץ המחסום. אם נמצא, וקטור עצמי SCF ו
מידע אחר יישמר בקובץ 42.

אל האני קלט התוכנית מחפשת דרך נתיב מילת המפתח המוגדר כברירת מחדל (ראשון קלט ולאחר מכן תקלות)
עבור מילות המפתח הבאות:

LABEL = מחרוזת
זוהי תווית תיאורית לחישוב. אין ברירת מחדל.

NORMBASIS = בוליאני
If NORMBASIS=כן, מקדמי המסלול המולקולרי של האורביטלים התפוסים הם
נתון במונחים של פונקציות בסיס חוזה מנורמלות. זה צריך להיות תמיד
נָכוֹן. ברירת המחדל היא אמת.

PRIMNORM = בוליאני
If PRIMNORM=כן, מקדמי הכיווץ של הפרימיטיבי D, F ו-G
הפונקציות המוקלטות צריכות להיות אלו המתאימות ל-D(XX) המנורמל,
פרימיטיביות F(XXX) ו-G(XXXX). כל ערכות הבסיס המסופקות עם Psi דורשות
שזה יהיה נכון. ברירת המחדל היא אמת.

תת קבוצה = מחרוזת
זוהי תת-הקבוצה שתשמש בחישוב. לשימוש בקבוצת נקודות C1
מחרוזת = C1; לשימוש Cs CS; לשימוש Ci CI; לשימוש C2 C2; לשימוש C2h C2H; עבור C2v
להשתמש C2V; ולשימוש D2 D2; אין ברירת מחדל.

UNIQUE_AXIS = מחרוזת
מילת מפתח זו מציינת איזה ציר במקור (לפני הציר הראשי
יש לבחור את מערכת הקואורדינטות כציר הייחודי ב-
מפרט תת קבוצות. לדוגמה, אם רוצים לבצע חישוב על D2h
מולקולה בסימטריה C2v, יש לציין איזה משלושת צירי C2 צריך
לשמש כציר הייחודי. אין ברירת מחדל.

יחידות = מחרוזת
If מחרוזת is BOHR, אז ה גֵאוֹמֶטרִיָה המערך נמצא ב-bohr. אם מחרוזת is אנגסטרום, לאחר מכן
מה היא גֵאוֹמֶטרִיָה המערך נמצא באנגסטום. ברירת המחדל היא BOHR.

גֵאוֹמֶטרִיָה = מערך
אל האני מערך הוא וקטור של קואורדינטות קרטזיות של כל אטום. כל מרכיב בזה
וקטור הוא וקטור אחר בצורה ( שם_atom x y z). אין ברירת מחדל.

ZMAT = מערך
אל האני מערך הוא מטריצת Z עבור המולקולה. כל אלמנט של וקטור זה הוא אחר
וקטור בצורה כללית ( שם_atom atomXNXX מרחק_קשר atomXNXX ערכיות_זווית
atomXNXX זווית_פיתול). שלושת האטומים הראשונים אינם דורשים את כל הפרמטרים
יש לציין אין ברירת מחדל.

PUREAM = בוליאני
If בוליאני is נכון, אז ישמשו פגזים עם מומנטום זוויתי טהור. לפיכך, D
למעטפת יהיו חמש פונקציות, למעטפת F יהיו שבע פונקציות, למעטפת G תהיה
יש תשע פונקציות וכו'. ברירת המחדל היא false.

בסיס = string/string_vector
אם ערכת הבסיס ניתנת כמחרוזת יחידה, אותה ערכת בסיס תשמש עבור כולם
אטומים. ניתן לציין את הבסיס שנקבע עבור כל אטום בוקטור מחרוזת חד-ממדית,
עם זאת, המשתמש חייב להיות זהיר, שכן רק ערכות בסיס עבור אטומים ייחודיים ייקראו
מהווקטור. ניתן להגדיר בסיס עבור כל סוג אלמנט באופן אנלוגי,
אולם כל רכיב של וקטור ערכת הבסיס חייב להיות וקטור המורכב משניים
אלמנטים: שם אלמנט ושם ערכת בסיס. אין ברירת מחדל.

BASIS_FILE = מחרוזת
מילת מפתח זו מציינת את השם של קובץ חלופי לחיפוש עבור ערכת בסיס
מֵידָע. או נתיב מוחלט לקובץ או נתיב יחסית לזרם
ניתן להשתמש בספרייה. אם המחרוזת מסתיימת על ידי "/" (רק הספרייה היא
שצוין) אז יצורף שם הקובץ המוגדר כברירת מחדל "basis.dat".

NO_REORIENT = בוליאני
מילת מפתח זו היא פריצה כדי לתת למשתמש יותר שליטה במצבים מסוימים כאשר
כיוון מחדש לתוך המסגרת הראשית מותיר כמה אלמנטים של סימטריה בלתי מזוהים.
כאשר מוגדר ל נכון, התוכנית תדלג על שלב כיוון מחדש זה. המשתמש אז
הופך להיות אחראי לספק אוריינטציה ראשונית המכוונת כהלכה
כדי לזהות את כל מרכיבי הסימטריה. זה יכול להיות מסובך עם מטריצות Z, לפיכך
רק מומחים צריכים להשתמש במילת מפתח זו.

KEEP_REF_FRAME = בוליאני
כאשר מילת מפתח זו מוגדרת ל-True Psi תעקוב אחר הקואורדינטה המקורית
מסגרת, כלומר מסגרת הקואורדינטות ממש אחרי מרכז הסטת המסה ולפניה
הכיוון מחדש לתוך המסגרת הראשית. מסגרת זו נקראת מסגרת התייחסות
ובאופן כללי, שונה ממסגרת הקואורדינטות הקנונית שאומצה ב-
סוף ריצת הקלט ומשמש לחישובים על ידי כל תוכניות מודולי Psi מעתה ואילך.
לכן, המידע על מסגרת הייחוס צריך להיות מאוחסן במחסום
קובץ if Psi מודולים (כגון CINTS) צריכים לשנות את התוצאות תלויות המסגרת שלהם
(כגון כוחות על הגרעינים) לתוך מסגרת הייחוס המקורית עבור חיצוני
תוכניות לשימוש. מילת מפתח זו הופכת שימושית בחישובי הבדלים סופיים
היכן שינויים בקבוצת הנקודות עלולים לגרום למולקולה להתמצא מחדש - מתי
KEEP_REF_FRAME מוגדר נכון כל ההדרגות פנימה קובץ11 יודפס באותו
מסגרת קואורדינטות.

הדפס = מספר שלם
זה שולט בכמות המידע שיודפס. ככל שהמספר גדול יותר -
ככל שיודפס מידע נוסף. ברירת מחדל (הדפס = 1) אמור להספיק לשגרה
שימוש.

בסיס סטים

אל האני קלט חיפוש תוכנית דרך ה בסיס נתיב מילות מפתח עבור מידע ערכת הבסיס.
תחילה הוא מחפש בקובץ של המשתמש, ואז מחפש בקובץ בעבודה
ספרייה (אם קיימת), ולאחר מכן דרך קובץ בסיס שצוין על ידי המשתמש שצוין על ידי
BASIS_FILE מילת מפתח (אם בכלל). לבסוף, הוא מחפש בקובץ בספריית Psi
מַדרִיך. השם של ערכת הבסיס שמחפשים מתקבל על ידי הוספת ה-
שם האטום לשם הבסיס עם ':' ביניהם. הפורמט של מידע ערכת הבסיס
מובן בצורה הטובה ביותר על ידי עיון בקובץ.

תקן בסיס סטים

Psi יכול להשתמש בערכות בסיס סטנדרטיות שמסופקות בקובץ בשם בספריית Psi
מַדרִיך. רבים משמות ערכות הבסיס מכילים תווים לא-אלפאנומריים. השמות האלה
חייב להיות מוקף ב-'"'.

STO זה מקבל את ערכת הבסיס STO-3G אשר זמינה עבור מימן-
אַרגוֹן. ערכות הבסיס STO-3G עבור האטומים שמכילים נתרן-ארגון
פונקציה D.

DZ זה מקבל סט בסיס כפול זיטה (DZ), שהוא (4s/2s) עבור
מימן, (9s5p/4s2p) עבור בורון-פלואור, ו-(11s7p/6s4p) עבור
אלומיניום-כלור.

(4S/2S) זה מקבל בסיס DZ מוגדר למימן.

(9S5P/4S2P) זה מקבל סט בסיס DZ עבור בורון-פלואור.

(11S7P/6S4P) זה מקבל סט בסיס DZ עבור אלומיניום-כלור.

DZP-OLD זהו סט בסיס DZ עם מעטפת של פונקציות קיטוב
הוסיף. המעריכים של פונקציות אלה הם הערך הישן. זה
זמין עבור מימן, בורון-פלואור ואלומיניום-כלור.

TZ-OLD ערכת הבסיס המשולשת זטה (TZ) הישנה היא (4s/3s) למימן,
(9s5p/5s3p) עבור בורון-פלואור, ו-(11s7p/7s5p) עבור אלומיניום-
כְּלוֹר. ערכת הבסיס של TZ היא זטה משולשת בערכיות בלבד.
בסיס זה ניתן לאימות של תוצאות ישנות; אל
תשתמש בזה.

TZP-OLD זהו ערכת הבסיס הישן של TZ עם פונקציות הקיטוב הישנות
הוסיף. זה זמין למימן, בורון-פלואור ו
אלומיניום-כלור. בסיס זה ניתן לאימות של
תוצאות ישנות; אל תשתמש בזה.

(5S/3S) זה מקבל בסיס TZ מוגדר למימן.

(10S6P/5S3P) זה מקבל ערכת בסיס TZ עבור בורון-ניאון. ערכת הבסיס של TZ היא
זיטה משולשת בערכיות בלבד.

(12S9P/6S5P) זה מקבל סט בסיס TZ עבור נתרן-ארגון. ערכת הבסיס של TZ היא
זיטה משולשת בערכיות בלבד.

1P_POLARIZATION זה מקבל קבוצה של פונקציות קיטוב למימן.

1D_POLARIZATION זה מקבל קבוצה של פונקציות קיטוב עבור בורון-פלואור ו
אלומיניום-כלור.

2P_POLARIZATION זה מקבל שתי קבוצות של פונקציות קיטוב למימן.

2D_POLARIZATION זה מקבל שתי קבוצות של פונקציות קיטוב עבור בורון-פלואור
ואלומיניום-כלור.

1D_POLARIZATION זה מקבל קבוצה של פונקציות קיטוב שניות למימן.

1F_POLARIZATION זה מקבל קבוצה של פונקציות קיטוב שניות עבור בורון-
פלואור ואלומיניום-כלור.

DZP זה מקבל בסיס (4S/2S) עם פונקציית "1P_POLARIZATION" עבור
מימן, בסיס (9S5P/4S2P) עם פונקציית "1D_POLARIZATION"
עבור ליתיום-פלורין, a (11S5P/7S2P) בתוספת שני P בעלי מזג אחיד
פונקציות עבור נתרן ומגנזיום, ובסיס (11S7P/6S4P) עם
פונקציית "1D_POLARIZATION" עבור אלומיניום-כלור.

TZ2P זה מקבל בסיס (5S/3S) עם פונקציות "2P_POLARIZATION" עבור
מימן, בסיס (10S6P/5S3P) עם פונקציות "2D_POLARIZATION"
עבור בורון-פלורין, ובסיס (12S9P/6S5P) עם
פונקציות "2D_POLARIZATION" עבור אלומיניום-כלור.

DZ_DIF זה מקבל בסיס DZ עם s מפוזר למימן, ומפוזר
s ו-p מפוזר עבור בורון-פלורין, ואלומיניום-כלור.

TZ_DIF זה מקבל בסיס TZ עם s מפוזר למימן, ומפוזר
s ו-p מפוזר עבור בורון-פלורין, ואלומיניום-כלור.

DZP_DIF זה מקבל את בסיס DZP עם s מפוזר למימן, ו-a
מפוזר s ו-p מפוזר עבור בורון-פלורין, ואלומיניום-
כְּלוֹר.

TZ2P_DIF זה מקבל את בסיס TZ2P עם s מפוזר למימן, ו-a
מפוזר s ו-p מפוזר עבור בורון-פלורין, ואלומיניום-
כְּלוֹר.

TZ2PF זה מקבל את הבסיס TZ2P ומוסיף "1D_POLARIZATION" למימן
ו-"1F_POLARIZATION" עבור בורון-פלורין ואלומיניום-כלור.

TZ2PD זה מקבל את הבסיס TZ2PF שנקבע למימן.

TZ2PF_DIF זה מקבל בסיס TZ2PF ומוסיף את ה-s המתאים
פונקציות עבור מימן ופונקציות מפוזרות s ו-p עבור בורון-
קמח, ואלומיניום-כלור.

CCPVDZ זה מקבל את הבסיס העקבי של המתאם המכווץ
הגדר cc-pVDZ, שהוא (4s1p/2s1p) למימן והליום,
(9s4p1d/3s2p1d) עבור ליתיום - ניאון, ו-(12s8p1d/4s3p1d) עבור
נתרן ואלומיניום - ארגון.

CCPVTZ זה מקבל את הבסיס העקבי של המתאם המכווץ
הגדר cc-pVTZ, שהוא (5s2p1d/3s2p1d) למימן והליום,
(10s5p2d1f/4s3p2d1f) for lithium - neon, and (15s9p2d1f/5s4p2d1f)
לנתרן ואלומיניום - ארגון.

CCPVQZ זה מקבל את הבסיס העקבי של המתאם המכווץ
הגדר cc-pVQZ, שזה (6s3p2d1f/4s3p2d1f) למימן ו
הליום, (12s6p3d2f1g/5s4p3d2f1g) עבור ליתיום - ניאון, ו
(16s11p3d2f1g/6s5p3d2f1g) לנתרן ואלומיניום - ארגון.

CCPV5Z זה מקבל את הבסיס העקבי של המתאם המכווץ
הגדר cc-pV5Z, שהוא (8s4p3d2f1g/5s4p3d2f1g) למימן ו
הליום, (14s8p4d3f2g1h/6s5p4d3f2g1h) עבור בריליום - ניאון, ו
(20s12p4d3f2g1h/7s6p4d3f2g1h) for aluminum - argon.

אנא הערה: הבסיס עקבי המתאם קובע cc-pVXZ (X =
D, T, Q, 5) מיועדים לשימוש עם תנע זוויתי טהור
פונקציות.

AUGCCPVDZ זה מקבל את ערכת הבסיס עקבית המתאם aug-cc-pVDZ, אשר
הוא ערכת הבסיס cc-pVDZ מוגברת עם מפוזר אופטימלי
פונקציות. זהו סט מפוזר (1s1p) למימן והליום
וסט מפוזר (1s1p1d) לליתיום - ניאון, נתרן ו
אלומיניום - ארגון.

AUGCCPVTZ זה מקבל את ערכת הבסיס עקבית המתאם aug-cc-pVTZ, אשר
הוא ערכת הבסיס cc-pVTZ מוגברת עם מפוזר אופטימלי
פונקציות. זהו סט מפוזר (1s1p1d) למימן ו
הליום וסט מפוזר (1s1p1d1f) לליתיום - ניאון, נתרן,
ואלומיניום - ארגון.

AUGCCPVQZ זה מקבל את ערכת הבסיס עקבית המתאם aug-cc-pVQZ, אשר
הוא ערכת הבסיס cc-pVQZ מוגברת עם מפוזר אופטימלי
פונקציות. זהו סט מפוזר (1s1p1d1f) למימן ו
הליום וסט מפוזר (1s1p1d1f1g) לליתיום - ניאון, נתרן,
ואלומיניום - ארגון.

AUGCCPV5Z זה מקבל את ערכת הבסיס עקבית המתאם aug-cc-pV5Z, אשר
הוא ערכת הבסיס cc-pV5Z מוגברת עם מפוזר אופטימלי
פונקציות. זהו סט מפוזר (1s1p1d1f1g) למימן ו
סט הליום ומפוזר (1s1p1d1f1g1h) עבור בריליום - ניאון ו
אלומיניום - ארגון.

GCVDZ סט בסיס חוזה כללי למימן, שעבורו הוא
(4s)/[2s], ועבור בורון-ניאון שעבורו הוא (9s4p)/[3s2p].

GCVTZ סט בסיס חוזה כללי למימן, שעבורו הוא
(5s)/[3s], ועבור בורון-ניאון שעבורו הוא (10s5p)/[4s3p].

GCVQZ סט בסיס חוזה כללי למימן, שעבורו הוא
(6s)/[4s], ועבור בורון-ניאון שעבורו הוא (12s6p)/[5s4p].

GCV1P זה מקבל מעטפת קיטוב P אחת למימן (לשימוש עם
GCVDZ).

GCV2P זה מקבל שתי קליפות קיטוב P למימן (לשימוש עם
GCVTZ).

GCV3P זה מקבל שלוש קליפות קיטוב P עבור מימן (לשימוש עם
GCVQZ).

GCV1D זה מקבל מעטפת קיטוב D אחת למימן (לשימוש עם
GCVTZ) ובור-ניאון (לשימוש עם GCVDZ).

GCV2D זה מקבל שתי קליפות קיטוב D למימן (לשימוש עם
GCVQZ) ובור-ניאון (לשימוש עם GCVTZ).

GCV3D זה מקבל שלוש קונכיות קיטוב D עבור בורון-ניאון (לשימוש
עם GCVQZ).

GCV1F זה מקבל מעטפת קיטוב F אחת למימן (לשימוש עם
GCVQZ) ובור-ניאון (לשימוש עם GCVTZ).

GCV2F זה מקבל שתי קונכיות קיטוב F עבור בורון-ניאון (לשימוש עם
GCVQZ).

GCV1G זה מקבל מעטפת קיטוב G אחת עבור בורון-ניאון (לשימוש עם
GCVQZ).

GCV1DPURE זהו GCV1D עם מומנטום זוויתי טהור מופעל במפורש.

GCV2DPURE זהו GCV2D עם מומנטום זוויתי טהור מופעל במפורש.

GCV3DPURE זהו GCV3D עם מומנטום זוויתי טהור מופעל במפורש.

GCV1FPURE זהו GCV1F עם מומנטום זוויתי טהור מופעל במפורש.

GCV2FPURE זהו GCV2F עם מומנטום זוויתי טהור מופעל במפורש.

GCV1GPURE זהו GCV1G עם מומנטום זוויתי טהור מופעל במפורש.

GCVDZP סט בסיס חוזה כללי למימן, שעבורו הוא
(4s1p)/[2s1p], ועבור בורון-ניאון, שעבורו הוא מיועד
(9s4p1d)/[3s2p1d].

GCVTZP סט בסיס חוזה כללי למימן, שעבורו הוא
(5s2p1d)/[3s2p1d], ועבור בורון-ניאון, שעבורו הוא מיועד
(10s5p2d1f)/[4s3p2d1f].

GCVQZP סט בסיס חוזה כללי למימן, שעבורו הוא
(6s3p2d1f)/[4s3p2d1f], ועבור בורון-ניאון שעבורו הוא מיועד
(12s6p3d2f1g)/[5s4p3d2f1g].

DUNNING_RYDBERG_3S זה מקבל מעטפת Rydberg עבור בורון-פלואור.

DUNNING_RYDBERG_3P זה מקבל מעטפת Rydberg עבור בורון-פלואור.

DUNNING_RYDBERG_3D זה מקבל מעטפת רידברג עבור בורון-פלואור ואלומיניום-
כְּלוֹר.

DUNNING_RYDBERG_4S זה מקבל מעטפת רידברג עבור בורון-פלואור ואלומיניום-
כְּלוֹר.

DUNNING_RYDBERG_4P זה מקבל מעטפת Rydberg עבור בורון-פלואור ואלומיניום-
כְּלוֹר.

DUNNING_RYDBERG_4D זה מקבל מעטפת Rydberg עבור בורון-פלואור.

DUNNING_NEGATIVE_ION_2P זה מקבל מעטפת מפוזרת עבור בורון-פלואור ואלומיניום-
כְּלוֹר.

WACHTERS זה מקבל בסיס (14s11p6d/10s8p3d) עבור אשלגן, סקנדיום-
אָבָץ.

321G זה מקבל בסיס של 3-21G עבור מימן-ארגון.

631G זה מקבל בסיס של 6-31G עבור מימן-ארגון.

6311G זה מקבל ערכת בסיס של 6-311G למימן-ניאון.

631GST זה מקבל בסיס של 6-31G* עבור מימן-ארגון.

631PGS זה מקבל בסיס של 6-31+G* עבור מימן-ארגון.

6311PPGSS זה מקבל בסיס 6-311++G** עבור מימן-ניאון.

PLUSS זה מקבל S מפוזר (Pople) למימן-ארגון.

PLUSP זה מקבל P מפוזר (Pople) למימן-ארגון.

דוגמא

הקלט הבא מיועד למולקולת המים:

ברירת מחדל: (
)

קלט: (
בסיס = dzp
גיאומטריה = ((o 0.0 0.00000000 0.00000000)
(h 0.0 -1.49495900 0.99859206)
(h 0.0 1.49495900 0.99859206))
)

הקלט הבא מקביל לדוגמא שלמעלה:

ברירת מחדל: (
)

קלט: (
בסיס = ((o dzp)
(h dzp) )
גיאומטריה = ((חמצן 0.0 0.00000000 0.00000000)
(מימן 0.0 -1.49495900 0.99859206)
(מימן 0.0 1.49495900 0.99859206))
)

להלן דוגמה למפרט Z-matrix

ברירת מחדל: (
)

קלט: (
בסיס = ((חמצן ccpv6z)
(מימן ccpv5z) )
zmat = ((x)
(o 1 1.0)
(h 2 0.995 1 127.75)
(h 2 0.995 1 127.75 3 180.0)
)
)

בסיס SET דוגמא

ניתן למקם את קלט השורות הבאות בקובץ קלט כדי להגדיר מחדש את DZP המימן
סט בסיס. שים לב שיש להשתמש במירכאות כפולות כאשר לשם ערכת בסיס יש מיוחד
דמויות בו.

בסיס: (
% הגדרה לבסיס DZP של מימן:
מימן:dzp = (
% מכניס מימן:dz:
(קבל "DZ")
% משתמש ב-pbasis.dat לקיטוב:
(קבל את "DUNNING_POLARIZATION")
)
% הגדרה לבסיס DZ של מימן:
מימן:dz = (
% מכניס מימן:"HUZINAGA-DUNNING_(9S/4S)":
(קבל את "HUZINAGA-DUNNING_(9S/4S)")
)
% הגדרה עבור בסיס מימן (9s/4s):
מימן:"HUZINAGA-DUNNING_(9S/4S)" = (
(S ( 19.2406 0.032828)
(2.8992 0.231208)
( 0.6534 0.817238))
(S ( 0.1776 1.0))
)
)

קבצים תת-סעיף דוגמא

ניתן למקם את קלט השורות הבאות בקובץ קלט כדי להגדיר מיקום חלופי
לחפש מידע על סט בסיס. שימו לב שיש להשתמש במירכאות כפולות כאשר יש למחרוזת
דמויות מיוחדות בו.

קלט: (
בסיס = (mydzp mydzp mydzp)
גיאומטריה = ((o 0.0 0.00000000 0.00000000)
(h 0.0 -1.49495900 0.99859206)
(h 0.0 1.49495900 0.99859206))
% אני אוהב לשמור הכל ביישומי הכימיה שלי
ספריית משנה %.
% ערכת הבסיס נמצאת
% /home/general/user/chem/my_very_own.basis
basis_file = "/home/general/user/chem/my_very_own.basis"
)

קלט: (
basis_file = "/home/general/user/basis/dzp_plus_diff/"
% אני אוהב לשמור הכל בספרייה משלו.
% ערכת הבסיס נמצאת
% /home/general/user/basis/dzp_plus_diff/basis.dat
בסיס = dzpdiff
גיאומטריה = ((o 0.0 0.00000000 0.00000000)
(h 0.0 -1.49495900 0.99859206)
(h 0.0 1.49495900 0.99859206) )
)

אחרון דברים

תוכנית זו נכתבה על ידי אדוארד פ. ואלייב, ד"ר ג'סטין ט. פרמן וטימותי ג'יי.
ואן הויס. המחברים רוצים להודות לד"ר ט. דניאל קרופורד ולרולין א. קינג על העזרה.
כל בעיה יש לשלוח למייל [מוגן בדוא"ל].

Psi Release 3 קלט(1)

השתמש בקלט מקוון באמצעות שירותי onworks.net