זוהי הפקודה maskAlignedReads שניתן להפעיל בספק האחסון החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
maskAlignedReads.py - מסכת קריאות מיושרות בקובץ אזורים
תיאור
שימוש: maskAlignedReads.py [-h] [-v] [-l LOGFILE] [-d] [-i]
inCmpFile inRgnFofn outRgnFofn
השתמש ב-in.cmp.h5 כדי להסוות אזורים תואמים של קבצים ב-in.rgn.h5, כתוב פלט לחדש
rgn.fofn.
מקומי טיעונים:
inCmpFile
קובץ קלט cmp.h5.
inRgnFofn
קטע של קבצי טבלת אזור קלט.
outRgnFofn
מבחר של קבצי טבלת אזור פלט.
אופציונלי טיעונים:
-h, - עזרה
הצג הודעת עזרה זו וצא
-v, --גִרְסָה
הצג את מספר הגרסה של התוכנית וצא
-l קובץ לוג, --קובץ לוג קובץ לוג
ציין קובץ להתחבר אליו. ברירת המחדל היא stderr. (ברירת מחדל: אין)
-d, --לנפות
מגביר את מילולי הרישום (ברירת מחדל: False)
-i, - מידע
הצג ערכי יומן אינפורמטיביים (ברירת מחדל: False)
השתמש ב-maskAlignedReads באופן מקוון באמצעות שירותי onworks.net
