זוהי הפקודה megamergere שניתן להריץ בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
megamerger - מיזוג שני רצפי DNA גדולים חופפים
תַקצִיר
מגה מיזוג -רצף רצף -בהמשך רצף -גודל מילים מספר שלם [-לְהַעֲדִיף בוליאני]
-outseq המשך -תיק אוסף
מגה מיזוג עזרה
תיאור
מגה מיזוג היא תוכנית שורת פקודה מבית EMBOSS ("האירופה מולקולרית ביולוגיה פתוחה
חבילת תוכנה"). זה חלק מקבוצת הפקודות "יישור: קונצנזוס".
אפשרויות
קֶלֶט סעיף
-רצף רצף
-בהמשך רצף
דרוש סעיף
-גודל מילים מספר שלם
ערך ברירת מחדל: 20
נוסף סעיף
-לְהַעֲדִיף בוליאני
כאשר מתגלה חוסר התאמה בין שני הרצף, אחד או אחר מהשניים
יש להשתמש ברצפים כדי ליצור את הרצף הממוזג על אזור חוסר התאמה זה. ה
פעולת ברירת המחדל היא ליצור את הרצף הממוזג באמצעות הרצף שבו אי ההתאמה
הוא הקרוב ביותר למרכז הרצף הזה. אם נעשה שימוש באפשרות זו, אז הרצף הראשון
(seqa) תמיד ישמש בעדיפות על הרצף האחר כאשר יש א
חוסר התאמה. ערך ברירת מחדל: N
תְפוּקָה סעיף
-outseq המשך
-תיק אוסף
השתמש ב-megamergere באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net
