זהו ניתוח הפקודה שניתן להפעיל בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
parseval - ניתוח השוואתי של שני מקורות ביאור חלופיים
תַקצִיר
parseval [אפשרויות] reference.gff3 prediction.gff3
תיאור
אפשרויות בסיסיות:
-d|--באגים:
הדפס הודעות איתור באגים
-h|--עזרה:
הדפס הודעת עזרה וצא
-l|--דלתא: INT
להרחיב את לוקוסי הגנים על ידי נוקלאוטידים רבים כל כך; ברירת המחדל היא 0
-V|--רבות:
הדפס הודעות אזהרה מילוליות
-v|--גרסה:
הדפס מספר גרסה וצא
אפשרויות פלט:
-a|--שיתוף נתונים: STRING
מיקום שממנו ניתן להעתיק נתונים משותפים לפלט HTML (אם 'בצע התקנה' לא
עדיין הופעל)
-f|--פורמט: STRING
ציין את פורמט הפלט הרצוי; אפשרויות אפשריות: 'csv', 'text' או 'html'
(default='text'); במצב 'טקסט' או 'csv', יצור קובץ בודד; ב-'html'
מצב, תיצור ספרייה
-g|--nogff3:
אל תדפיס פלט GFF3 המתאים לכל השוואה
-o|--outfile: FILENAME
קובץ/ספרייה שאליו ייכתב הפלט; ברירת המחדל היא הטרמינל (STDOUT)
-p|--nopng:
במצב פלט HTML, דלג על יצירת גרפיקת PNG עבור כל מוקד גן
-s|--סיכום:
הדפס רק סטטיסטיקות סיכום, אל תדפיס השוואות בודדות
-w|--דרוס:
כפה החלפה של קבצי פלט קיימים
-x|--refrlabel: STRING
תווית אופציונלית להערות עזר
-y|--predlabel: STRING
תווית אופציונלית להערות חיזוי
אפשרויות סינון:
-k|--makefilter
צור קובץ תצורה ברירת מחדל לסינון תוצאות מדווחות וצא,
ללא השוואות
-r|--פילטרקובץ: STRING
השתמש בקובץ התצורה המצוין כדי לסנן את התוצאות המדווחות;
-t|--maxtrans: INT
מקסימום תמלול מותר לכל לוקוס; השתמש ב-0 כדי להשבית מגבלה; ברירת המחדל היא 32
השתמש ב-parseval באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net
