זוהי הפקודה xtractore שניתן להפעיל בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
xtractore - חלץ רצפים התואמים לתכונות מוערות מהרצף הנתון
פילה
תַקצִיר
xtractore [אפשרויות] features.gff3 sequences.fasta
תיאור
אפשרויות:
-d|--ניפוי באגים
הדפסת פלט ניפוי באגים
-h|--עזרה
הדפס הודעת עזרה זו וצא
-i|--idfile: FILE
קובץ המכיל רשימה של מזהי תכונה (1 בשורה ללא רווחים); אם מסופק,
רק תכונות עם מזהים בקובץ זה יחולצו
-o|--outfile: FILE
קובץ שאליו ייכתבו רצפי פלט; ברירת המחדל היא טרמינל (stdout)
-t|--סוג: STRING
סוג תכונה לחילוץ; ניתן להשתמש מספר פעמים כדי לחלץ תכונות של מספר רב
סוגים
-v|--גרסה
להדפיס את מספר הגרסה ולצאת
-V|--רבות
הדפס הודעות אזהרה ושגיאה מילוליות
-w|--רוחב: INT
רוחב של כל שורה של רצף בפלט Fasta; ברירת המחדל היא 80; מוגדר ל-0 עבור לא
עיצוב
השתמש ב-xtractore באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net
