זוהי אפליקציית לינוקס בשם AmpliMethProfiler, שאת הגרסה האחרונה שלה ניתן להוריד בשם AmpliMethProfiler_1.2.tar.gz. ניתן להריץ אותה באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks לתחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם AmpliMethProfiler עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
AmpliMethProfiler
Ad
תיאור
הכלי ampliMethProfiler מספק דרך קלה וידידותית למשתמש לחלץ ולנתח את הרכב האפי-הפלוטייפ של קריאות מניסויי רצף ביסולפיט ממוקדים.באופן ספציפי, ampliMethProfiler מספק דרך קלה וידידותית למשתמש לחלץ ולנתח את ההרכב האפיאלי של קריאות מניסויי רצף ביסולפיט ממוקדים. ampliMethProfiler כתוב בשפת python ודורש התקנה מקומית של כלי BLAST ו-QIIME. ניתן להפעיל אותו על פלטפורמות Linux ו-OS X.
איך לצטט אותנו:
"ampliMethProfiler: צינור לניתוח פרופילי מתילציה של CpG של אמפליקונים ממוקדים ברצף ביסולפיט עמוקים". סקאלה G., et al. BMC Bioinformatics (2016) 17:484,
DOI: 10.1186/s12859-016-1380-3
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/amplimethprofiler/. זה התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
