זוהי אפליקציית לינוקס בשם ArtificialFastqGenerator שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בתור ArtificialFastqGenerator_19_05_2015.zip. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם ArtificialFastqGenerator עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
ArtificialFastqGenerator
Ad
תיאור
ArtificialFastqGenerator לוקח את גנום הייחוס (בפורמט FASTA) כקלט ומוציא קבצי FASTQ מלאכותיים בפורמט Sanger. זה יכול לקבל ציוני איכות בסיסיים של Phred מקובצי FASTQ קיימים, ולהשתמש בהם כדי לדמות שגיאות רצף. מכיוון שה-FASTQs המלאכותיים נגזרים מגנום הייחוס, גנום הייחוס מספק תקן זהב לקריאת וריאנטים (Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) והכנסות ומחיקות (indels)). זה מאפשר הערכה של צינור ניתוח של רצף הדור הבא (NGS) שמיישר קריאות לגנום הייחוס ואז קורא לווריאנטים.קהל
תעשיית הבריאות, מדע/מחקר, משתמשי קצה מתקדמים
שפת תכנות
Java
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/artfastqgen/. הוא התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.