זוהי אפליקציית לינוקס בשם bspipe, שאת הגרסה האחרונה שלה ניתן להוריד כקובץ bspipe-1.3.zip. ניתן להריץ אותה באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks לתחנות עבודה.
הורד והפעל אונליין את האפליקציה הזו בשם bspipe עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
צינור
Ad
תיאור
BSpipe הוא צינור מקיף מבקרת איכות רצף ומיפוי ועד לניתוח פונקציונלי של אזורים בעלי מתיל דיפרנציאלי:
(1) הערכת איכות ברצף,
(2) ניקוי רצף,
(3) מיפוי קריאה ברצף,
(4) כימות מתילציה,
(4) השוואות מדגמיות המבוססות על פרופיל מתילציה,
(5) זיהוי של DMRs (אזורים מתילטים דיפרנציאליים),
(6) ביאור של DMRs,
(7) ניתוח פונקציונלי של גנים בעלי מתיל דיפרנציאלי,
(8) יצירת קבצי קלט להדמיה, וכן
(9) תמיכה בטכנולוגיות רצף מתקדמות כגון TAB-seq, OxBS-seq, MAP-it ו-NOMe-seq.
קהל
מדע/מחקר
ממשק משתמש
שורת הפקודה
שפת תכנות
Unix Shell, Perl, S/R
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/bspipe/. זה התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
