זוהי אפליקציית לינוקס בשם CaptureProbe שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בתור Runningexample.zip. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם CaptureProbe עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
CaptureProbe
Ad
תיאור
כאן פיתחנו את CaptureProbe, כלי Java ידידותי למשתמש וגרפי לעיצוב בדיקות לכידה עבור יישומי Capture Hi-C. CaptureProbe קל לשימוש, צריך רק קבצי קלט פשוטים ומספק פרמטרים רבים לתכנון בדיקות. CaptureProbe יכול לעצב בדיקות ספציפיות הן לאתרים גנומיים והן לאזורים גנומיים בעלי עניין. השוואות לתוכנות קיימות (HiCapTools ו-GOPHER) הצביעו על כך של-CaptureProbe יש יחס הצלחה עיצובי טוב וסגוליות בדיקה טובה יותר.
ציטוט: MA YF, ADEOLA AC, SUN YB, et al. 2020. CaptureProbe: כלי ג'אווה לתכנון בדיקות עבור יישומי Hi-C לכידה. Zool Res [J], 41: 94-96.
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/captureprobe/. הוא התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
