זוהי אפליקציית לינוקס בשם CStone שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בשם cstone.zip. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם CStone עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
בצילומי מסך
Ad
CStone
תיאור
CStone הוא מעבד דה נובו לנתוני RNA-Seq שמשתמש בגרפים כמו דה Bruijn ומביא הערות לכל קונטיג המיוצר באחת משלוש רמות סיווג גרפים המציינות אם ניתן להבטיח שהוא לא כימרי או לא. רמות הסיווג תלויות במורכבות משפחת הגנים שממנה נגזרות הקריאות. כתוצר לוואי, זה גם מספק תובנה לגבי ההרכב המבני של משפחות הגנים הבסיסיות שנקבעו. פרטים נוספים יהיו זמינים בקרוב בעיתון שלנו: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34813594/.
תכונות
- הרכבה דה נובו של נתוני RNA-Seq.
- זיהוי של contigs לא כימריים.
- תאימות בין פלטפורמות.
- צנצנת ניתנת להפעלה זמינה.
- אין צורך בחבילות חיצוניות.
- קוד קל למעקב ומשולב בכלים אחרים.
- מידע על המורכבות של משפחות הגנים הבסיסיות.
- דה Bruijn כמו גישה (קלה יותר).
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/cstone/. זה התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
