זוהי אפליקציית לינוקס בשם EXCAVATOR-tool להפעלה בלינוקס מקוונת, שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בתור EXCAVATOR_Package_v2.2.tgz. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באופן מקוון את האפליקציה הזו בשם EXCAVATOR-tool להפעלה בלינוקס באופן מקוון עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
בצילומי מסך
Ad
EXCAVATOR-כלי להפעלה בלינוקס באינטרנט
תיאור
שימו לב!!!!! שימו לב!!!!! שימו לב!!!!!לאחרונה פרסמנו ב-BMC Genomics חבילת תוכנה חדשה, בשם XCAVATOR, לזיהוי של CNVs/CNAs מניסויי רצף שלם של גנום קריאה קצרה וארוכה (https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-017-4137-0).
XCAVATOR זמין בחינם ב- http://sourceforge.net/projects/xcavator/.
EXCAVATOR היא חבילת תוכנה חדשה לזיהוי גרסאות של מספר העתקות (CNVs) מנתוני רצף אקסומים שלמים.
EXCAVATOR פורסם ב-Genome Biology (http://genomebiology.com/2013/14/10/R120/abstract).
#####################
תשומת הלב!!!!! על מנת להשתמש כראוי בכלי ה-EXCAVATOR, על המשתמשים להוריד את קבצי המיפוי הייחודיים בקישור הבא:
http://grimmond.imb.uq.edu.au/uniqueome/downloads/hg19_uniqueome.coverage.base-space.25.1.Wig.gz (עבור hg19)
http://grimmond.imb.uq.edu.au/uniqueome/downloads/hg18_uniqueome.coverage.base-space.25.1.Wig.gz
תכונות
- רצף הדור הבא
- העתק גרסאות מספר
- רצף שלם של Exome
שפת תכנות
פרל
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/excavatortool/. הוא התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
