זוהי אפליקציית לינוקס בשם GEPETTO - Gene Prioritization in Java, אשר את הגרסה האחרונה שלה ניתן להוריד כקובץ README.txt. ניתן להריץ אותה באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks לתחנות עבודה.
הורד והפעל אונליין את האפליקציה GEPETTO - Gene Priorityization in Java with OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
בצילומי מסך
Ad
GEPETTO - קביעת סדרי עדיפויות של גנים בג'אווה
תיאור
GEPETTO (GEne PrioriTization ExTended TOol) היא מסגרת קוד פתוח מקורית, המופצת תחת רישיון LGPL, לבחירה וקביעת סדרי עדיפויות של גנים במחשב שולחני, המבטיחה סודיות של נתונים אישיים. היא מנצלת את יכולות שילוב הנתונים במסגרת SM2PH-Central (KD4v, MSV3d, BIRD,...), בשילוב עם שיטות קביעת סדרי עדיפויות של גנים שפותחו באופן פנימי. כיום היא משלבת שישה מודולי קביעת סדרי עדיפויות, המבוססים על רצף גנים, אינטראקציות חלבון-חלבון, ביטוי גנים, הסתברויות גורמות מחלות, הקשר גנומי.
GEPETTO כתוב ב-Java/Python ונתמך על ידי ארכיטקטורה מודולרית מתקדמת, מה שאומר שניתן בקלות לשנות ולהרחיב אותה על ידי המשתמש, על מנת לכלול שיטות ניקוד חלופיות ומקורות נתונים חדשים. אנו מתכוונים להרחיב את המערכת מתעדוף ברמת הגן לתעדוף ברמת הווריאנט, על ידי ניצול נתוני הווריאנטים במסד הנתונים MSV3D.
איש קשר: [מוגן בדוא"ל] or [מוגן בדוא"ל]
קהל
מדע/מחקר, חינוך, מפתחים
ממשק משתמש
מבוסס אינטרנט, מסוף/מסוף, שורת פקודה
שפת תכנות
פייתון, ג'אווה, S/R
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להוריד גם מ-https://sourceforge.net/projects/gepetto/. היא אוחסנה ב-OnWorks על מנת שניתן יהיה להפעיל אותה באופן מקוון בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
