זוהי אפליקציית לינוקס בשם MaxBin2, אשר את הגרסה האחרונה שלה ניתן להוריד בשם MaxBin-2.2.7.tar.gz. ניתן להריץ אותה באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks לתחנות עבודה.
הורד והפעל אונליין את האפליקציה הזו בשם MaxBin2 עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
בצילומי מסך
Ad
מקסבין2
תיאור
MaxBin2 הוא הדור הבא של MaxBin (https://sourceforge.net/projects/maxbin/) התומכת בדגימות מרובות בו זמנית. MaxBin היא תוכנה לחלוקה לרצפים מטאגנומיים מורכבים המבוססת על אלגוריתם מקסום ציפיות. משתמשים יכולים להבין את הגנומים (bins) הבסיסיים של המיקרואורגניזמים במטאגנומים שלהם פשוט על ידי מתן רצפי מטאגנומיים מורכבים ומידע כיסוי הקריאות או קריאות ריצוף. לנוחיות המשתמשים, MaxBin ידווח סטטיסטיקות הקשורות לגנום, כולל שלמות משוערת, תוכן GC וגודל הגנום בדף סיכום החלוקה לרצף. משתמשים יכולים להשתמש ב-MEGAN או בתוכנה דומה על רצפי MaxBin כדי לגלות את הטקסונומיה של כל סל לאחר סיום תהליך החלוקה לרצף.מידע נוסף ניתן למצוא באתר האינטרנט הרשמי של MaxBin: http://downloads.jbei.org/data/microbial_communities/MaxBin/MaxBin.html
תכונות
- Metagenomics Binning
שפת תכנות
C + +
זוהי אפליקציה שניתן להוריד גם מ-https://sourceforge.net/projects/maxbin2/. היא אוחסנה ב-OnWorks על מנת שניתן יהיה להריץ אותה באופן מקוון בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.