זוהי אפליקציית לינוקס בשם MetaPhat -meta-pheno-association-tracker שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בשם meta_phat.tar.gz. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם MetaPhat -meta-pheno-association-tracker עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
בצילומי מסך
Ad
MetaPhat -meta-pheno-association-tracker
תיאור
MetaPhat הוא כלי פעיל ומקור פתוח (רישיון MIT) לזיהוי גרסאות עם אסוציאציות רב-משתניות על ידי שימוש בסטטיסטיקות סיכום ממחקרי GWAS חד-משתנים. האפליקציה גם מבצעת פירוק על ידי מציאת תת-קבוצות BIC אופטימליות ותכונות דרייבר של ערכי P עבור גרסאות ההובלה הרב-משתניות. תוצאות שונות מתחקות ומקובצות במקבצים כדי לסייע בניתוח יחסי פנוטיפים-גנוטיפ.אנא עיין בבית הוויקי שלנו לקבלת הוראות התקנה, פורמטי נתונים נדרשים של GWAS וכניסות לדוגמה עם פקודת בדיקה - https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Home/
ליפידים גלובליים (GLGC, Willer 2013) דוגמה לנתונים/מקור זפת - https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/files/Dist/meta_phat.tar.gz/download
אם נתקלת בבעיות או שיש לך בקשות לתכונה לאחר שניסית דוגמה וקריאת הדרכה, אנא שלח דוא"ל: [מוגן בדוא"ל]
זכויות יוצרים <2019> [מוגן בדוא"ל], [מוגן בדוא"ל]
תכונות
- ניתוח תכונות של גנום רב משתני
- בחירת תת-קבוצה אופטימלית מבוססת ערך p ו-BIC
- עלילות עקבות פירוק תכונה
- lead SNP וקובץ סיכום תכונת נהג
- snp-snp תכונה דרגה אשכול חוד
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מאתר https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/. הוא התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
