זוהי אפליקציית לינוקס בשם MoPAC, שאת הגרסה האחרונה שלה ניתן להוריד בשם MoPAC_0.3.1.tar.gz. ניתן להריץ אותה באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks לתחנות עבודה.
הורד והפעל אונליין את האפליקציה הזו בשם MoPAC עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
בצילומי מסך
Ad
MoPAC
תיאור
כדי להקל על השוואת חיוניות גנים בשתי דגימות תאים או יותר, אנו מציעים את MoPAC (Modular Pipeline for Analysis of CRISPR screens), כלי אינטראקטיבי מונחה Shiny לניתוח חיוניות דיפרנציאלי במסכי CRISPR/Cas9.
להוראות התקנה ושימוש אנא עיינו בדף הוויקי.
תכונות
- מדידה בלתי משוחדת של חיוניות גנים דיפרנציאלית במסכי CRISPR.
- קלות שימוש באמצעות ממשק משתמש גרפי אינטראקטיבי.
- נתונים מוכנים לפרסום שנוצרו בכל שלב של הניתוח.
- גם קבצי FASTQ וגם טבלאות ספירת קריאות (לפני או אחרי נרמול) מותרים כקלט.
- בקרת איכות מבוססת קטגוריות גנים לגילוי וסינון חריגים.
- ניתוח אונטולוגיה גנטית מובנה דרך חבילת STRINGdb R.
- עיבוד מהיר באמצעות קומפילציה של C++ של שלבים עתירי חישוב.
קהל
מדע/מחקר
ממשק משתמש
מבוסס רשת
שפת תכנות
C++, S/R
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להוריד גם מ-https://sourceforge.net/projects/mopac/. היא אוחסנה ב-OnWorks על מנת שניתן יהיה להפעיל אותה באופן מקוון בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
