זוהי אפליקציית לינוקס בשם PARSEC - Pattern Search / Context שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בתור PARSEC_Deployment_Package_v2.zip. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם PARSEC - Pattern Search / Context with OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
בצילומי מסך
Ad
PARSEC - חיפוש דפוסים / הקשר
תיאור
אפיון אתרים גנומיים הוא אתגר מרכזי בהבנה ובניצול של נתוני רצף הדור הבא. רוב האתרים הגנומיים מיוצגים על ידי מוטיבים קצרים ומנוונים עם תפוצה מפוזרת ולעיתים עם תפקוד ביולוגי (לדוגמה: ויסות של ביטוי גנים, דפוסי שחבור או אותות אפיגנטיקה). מוטיבים אלו קשורים לכמות עצומה של רעש ולכן, פיתוח פלטפורמה חישובית לזיהוי מדויק של אתרים גנומיים מצריך שילוב של נתונים ביולוגיים שונים בקנה מידה גדול על מנת לסנן תוצאות חיוביות שגויות.
PARSEC מייצג פתרון אינטואיטיבי, מודולרי (ניתן להרחבה בקלות) והכל-ב-אחד לאינטגרציה יעילה של הרבה מידע גנומי מגוון על מנת לבצע לוקליזציה ואפיון לא ליניארי של אתרים ביולוגיים בסביבה ידידותית למשתמש.
עיין בוויקי לדרישות חומרה ודפדפנים נתמכים.
קהל
מדע/מחקר
ממשק משתמש
מבוסס רשת
שפת תכנות
C++, Java
סביבת מסד נתונים
JDBC, MySQL, PostgreSQL (pgsql)
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/genomicparsec/. זה התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
