זוהי אפליקציית לינוקס בשם piv_clustering להפעלה בלינוקס מקוונת, שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בשם piv_clustering_1.3.tar.gz. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באופן מקוון את האפליקציה הזו בשם piv_clustering כדי לרוץ בלינוקס באופן מקוון עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
בצילומי מסך
Ad
piv_clustering להפעלה בלינוקס באינטרנט
תיאור
תוכנית זו מאפשרת לבצע ניתוח אשכולות מבני של מסלולים אטומיים המתקבלים, למשל, מסימולציות דינמיקה מולקולרית.בשונה מגישות אחרות, ניתן לנתח גם תהליכים בתמיסה, למשל, תגובות כימיות במים נוזליים, מכיוון שמדד המרחק מבוסס על וקטור Permutation Invariant (PIV) שהוא סימטרי בהחלפה של אטומים או מולקולות זהות, כולל באותה בסיס דרגות חופש מומסות וממסות כאחד. הגישה היא כללית וההגדרה של PIV דורשת רק לציין את טווח המרחקים הבין-אטומיים הרלוונטיים לתהליך הנחקר. לחלופין, ניתן להשתמש גם בקואורדינטות הטופולוגיות של SPRINT, המתאימות במיוחד לננו-מבנים.
הפלט הוא חלוקה של המסלול לכמה אשכולות מבניים (כלומר, קבוצות של פריימים), המאפשר ניתוח והדמיה פשוטים יותר.
אנא קרא וציטט את Gallet & Pietrucci, J. Chem. פיזי. 139, 074101 (2013)
תכונות
- מקבץ מבני של מסלולים אטומיסטיים
- אי-ווריאציות תמורה: גבישים, מוצקים אמורפיים, נוזלים, ננו-מבנים
- כל תאי הסימולציה נתמכים (מאורתורומבי ועד טריקלינינק)
- יישום MPI מקביל
קהל
מדע/מחקר
שפת תכנות
פורטרן
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/pivclustering/. הוא התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
