זוהי אפליקציית לינוקס בשם StatAlign, שאת הגרסה האחרונה שלה ניתן להוריד כ-StatAlign-v2.1.zip. ניתן להריץ אותה באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks לתחנות עבודה.
הורד והפעל אונליין את האפליקציה הזו בשם StatAlign עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
סטט-אליין
Ad
תיאור
StatAlign היא חבילת תוכנה ניתנת להרחבה לניתוח בייסיאני של רצפי חלבונים, DNA ו-RNA. יישורים מרובים, עצים פילוגנטיים ופרמטרים אבולוציוניים מוערכים יחד במסגרת מונטה קרלו של שרשרת מרקוב, מה שמאפשר מדידה אמינה של דיוק התוצאות.
גישה זו מבטלת ארטיפקטים נפוצים ששיטות מסורתיות סובלות מהם, במחיר של זמן חישוב מוגבר. ארטיפקטים אלה כוללים את התלות של הפילוגניה הבנויה ביישור יחיד (כנראה לא אופטימלי) והטיה לכיוון עץ המדריך עליו מסתמך היישור.
המודלים העומדים מאחורי הניתוח מאפשרים השוואה של רצפים מרוחקים מבחינה אבולוציונית: ניתן לחבר את מודל ההחדרה-מחיקה של TKF92 למודל החלפה שרירותי. מגוון רחב של מודלים לנתוני נוקלאוטידים וחומצות אמינו כלול בחבילה ומערכת ניהול התוספים מבטיחה שניתן להוסיף בקלות מודלים חדשים.
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להוריד גם מאתר https://sourceforge.net/projects/statalign/. היא אוחסנה ב-OnWorks על מנת שניתן יהיה להפעיל אותה באופן מקוון בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
