זוהי אפליקציית לינוקס בשם Subread אשר את המהדורה האחרונה שלה ניתן להוריד כ-subread-2.0.4-Windows-x86_64.tar.gz. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם Subread עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
קריאה משנה
Ad
תיאור
חבילת התוכנה Subread היא ערכת כלים לעיבוד נתוני רצף מהדור הבא. הוא כולל יישור Subread, גלאי צומת אקסון-אקסון Subjunc ותוכנית סיכום קריאה של featureCounts.
ניתן להשתמש ב-subread aligner ליישור קריאות gDNA-seq ו-RNA-seq. יישור Subjunc צוין שנועד לזיהוי צומת אקסון-אקסון. למיפוי של קריאות RNA-seq, Subread מבצע יישור מקומי ו-Subjunc מבצע יישור גלובלי. Subread ו-Subjunc פורסמו במאמר הבא: Yang Liao, Gordon K Smyth ו-Wei Shi. "יישור המשנה: מיפוי קריאה מהיר, מדויק וניתן להרחבה על ידי זריעה והצבעה", Nucleic Acids Research, 2013, 41(10):e108
תכונות
- קריאת יישור
- רצף הדור הבא
קהל
מדע/מחקר
ממשק משתמש
שורת הפקודה
שפת תכנות
C
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/subread/. זה התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
