זוהי אפליקציית לינוקס בשם UniPyRange לרוץ בלינוקס מקוון שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בשם UniPyRangeSuite.py. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באופן מקוון את האפליקציה הזו בשם UniPyRange כדי לרוץ בלינוקס באופן מקוון עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
בצילומי מסך
Ad
UniPyRange לרוץ בלינוקס מקוון
תיאור
סקריפט python פשוט מאוד שחוסך מכם את הכאבים של ספירת חומצות האמינו/בסיסי ה-DNA בקבצי fasta ממסד הנתונים Uniprot ו-NCBI RefSeq (1, 2).נניח שאתה רוצה את רצף חומצות האמינו בטווח 128-387 מחלבון של 1000 חומצות אמינו - סקריפט זה יעזור לך להימנע מספירת טעויות רק על ידי הצגת הרצף שצוין בחומצות אמינו ובקידוד זוגות בסיסים של DNA (אידיאלי לעיצוב פריימר הגברה ) של מזהה Uniprot שצוין.
- דורש BioPython (3) וחבילת Bioservices (4)
(1)
קונסורציום UniProt
UniProt: מרכז מידע על חלבון
Nucleic Acids Res. 43: D204-D212 (2015).
(2)
RefSeq: עדכון על רצפי התייחסות של יונקים. Nucleic Acids Res. 2014 ינואר 1;42(1):D756-63.
(3)
Cock PJ et al. ביואינפורמטיקה (2009)
(4)
Cokelaer et al, Bioinformatics (2013)
שפת תכנות
פיתון
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/unipyrange/. הוא התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.