![הורדה חינם של ViralFusionSeq [VFS] להפעלה באפליקציית לינוקס מקוונת של לינוקס להפעלה מקוונת באובונטו מקוונת, פדורה מקוונת או דביאן מקוונת](https://www.onworks.net/imagescropped/viralfusionseq[vfs]toruninlinuxonlineicon.png_3.webp "הורדת ViralFusionSeq [VFS] להפעלה באפליקציית לינוקס מקוונת של לינוקס להפעלה מקוונת באובונטו מקוונת, פדורה מקוונת או דביאן מקוונת")
זוהי אפליקציית לינוקס בשם ViralFusionSeq [VFS] להפעלה בלינוקס מקוונת, שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בשם vfs-2016-08-17.r2.tar.gz. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באופן מקוון את האפליקציה הזו בשם ViralFusionSeq [VFS] כדי לרוץ בלינוקס באופן מקוון עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
בצילומי מסך
Ad
![הורד את כלי האינטרנט או אפליקציית האינטרנט ViralFusionSeq [VFS] כדי להפעיל בלינוקס באופן מקוון](https://www.onworks.net/imagescropped/viralfusionseq[vfs]toruninlinuxonlinescreenshot1.png_3.webp "הורד את כלי האינטרנט או אפליקציית האינטרנט ViralFusionSeq [VFS] כדי להפעיל בלינוקס באופן מקוון")
![הורד את כלי האינטרנט או אפליקציית האינטרנט ViralFusionSeq [VFS] כדי להפעיל בלינוקס באופן מקוון](https://www.onworks.net/imagescropped/viralfusionseq[vfs]toruninlinuxonlinescreenshot2.png_3.webp "הורד את כלי האינטרנט או אפליקציית האינטרנט ViralFusionSeq [VFS] כדי להפעיל בלינוקס באופן מקוון")
ViralFusionSeq [VFS] לרוץ בלינוקס מקוון
תיאור
VFS נבדק במלואו תחת מערכת אובונטו/דביאן.** הודעה 1**: VFS עדיפה על Virus-Clip. https://sourceforge.net/projects/viralfusionseq/files/VFS.vs.Virus-Clip.pdf/download
נכון לשנת 2016, VFS הוא כלי האינטגרציה הוויראלי היחיד הזמין במערכת NIH HPC.
https://hpc.nih.gov/apps/ViralFusionSeq/
ViralFusionSeq (VFS) הוא כלי רב-תכליתי לרצף תפוקה גבוהה (HTS) לגילוי אירועי אינטגרציה ויראליים ושחזור תמלולי היתוך ברזולוציה של בסיס יחיד.
VFS משלב מידע חיתוך רך, ניתוח צמד קריאה והרכבה דה נובו ממוקדת כדי לגלות ולערוך אירועי היתוך ויראלי-אנושי.
מודל סטטיסטי אמפירי פשוט אך יעיל משמש להערכת איכות נקודות היתוך.
נדרשים פרמטרים מינימליים המוגדרים על ידי המשתמש.
קוד מקור עם מדריך למשתמש ומדריך התקנה של VFS זמין בסעיף "קבצים" של sourceforge.
צִיטָטָה: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/
תכונות
- ישים ונבדק במלואו באמצעות נתוני RNA-Seq ו-DNA-Seq
- השתמש גם במידע ברצף קצוץ (CS) וגם במידע קצה מזווג (RP) כדי לגלות אינטגרציה ויראלית
- בנייה מחדש של רצף תמליל היתוך באמצעות מידע CS ו-RP
קהל
מדע/מחקר
שפת תכנות
פרל
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/viralfusionseq/. זה התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
