זוהי אפליקציית Windows בשם Genome Microsatellite Analyzing Tool, אשר את הגרסה האחרונה שלה ניתן להוריד כקובץ gmatoV1.2Build20130106.zip. ניתן להריץ אותה באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks לתחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם Genome Microsatellite Analyzing Tool עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל כל אמולטור מקוון של OS OnWorks מאתר זה, אך עדיף אמולטור מקוון של Windows.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Windows שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה והתקן אותה.
- 7. הורד את Wine ממאגרי התוכנה שלך להפצות לינוקס. לאחר ההתקנה, תוכל ללחוץ פעמיים על האפליקציה כדי להפעיל אותם עם Wine. אתה יכול גם לנסות את PlayOnLinux, ממשק מפואר מעל Wine שיעזור לך להתקין תוכניות ומשחקים פופולריים של Windows.
Wine היא דרך להפעיל תוכנת Windows על לינוקס, אך ללא צורך ב-Windows. Wine היא שכבת תאימות של Windows בקוד פתוח שיכולה להריץ תוכניות Windows ישירות על כל שולחן עבודה של לינוקס. בעיקרו של דבר, Wine מנסה להטמיע מחדש מספיק של Windows מאפס כדי שהוא יוכל להריץ את כל יישומי Windows מבלי להזדקק ל-Windows.
בצילומי מסך
Ad
כלי ניתוח מיקרו-לוויין של הגנום
תיאור
הזמינות הגוברת של הרצף של יותר ויותר גנומים שלמים ענקיים (>1G) הביסה את כלי הניתוח הקיימים כיום של SSR. כלי ניתוח מיקרו-לווין (GMATo) הוא תוכנית חדשה וחזקה לכריית SSR מהירה יותר בכל אורך, בכל גודל וניתוח סטטיסטי מקיף בהיבט הגנום, שתוכננה במיוחד עבור גנום ענק המבוסס על סקריפטים של Perl. נדרש רק קובץ קלט אחד המכיל רצפי DNA בפורמט fasta גולמי וקבצי פלט בפורמט טבלאי מפרטים את כל מידע מיקומי SSR והפצה סטטיסטית בארבעה סיווגים מעוניינים ביולוגים. ל-GMATo יש גם ממשק משתמש קל וגרפי המתוכנן ב-Java וממשק שורת פקודה ב-Perl, או פועל בפלטפורמות Windows, Linux ו-Mac וכו' עם בקרת פרמטרים מותאמת אישית עבור ביולוגים וביו-אינפורמטיקה. תוכנת GMATo היא כלי טוב יותר לאפיון SSR בגנום ענקציטו מאמר זה: Wang X. et al, Bioinformation [2013, 9(10):541-544]
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/gmato/. הוא התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
