זוהי אפליקציית Windows בשם Scaffold_Builder שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בתור scaffold_builder_v2.2.zip. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם Scaffold_Builder עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל כל אמולטור מקוון של OS OnWorks מאתר זה, אך עדיף אמולטור מקוון של Windows.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Windows שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה והתקן אותה.
- 7. הורד את Wine ממאגרי התוכנה שלך להפצות לינוקס. לאחר ההתקנה, תוכל ללחוץ פעמיים על האפליקציה כדי להפעיל אותם עם Wine. אתה יכול גם לנסות את PlayOnLinux, ממשק מפואר מעל Wine שיעזור לך להתקין תוכניות ומשחקים פופולריים של Windows.
Wine היא דרך להפעיל תוכנת Windows על לינוקס, אך ללא צורך ב-Windows. Wine היא שכבת תאימות של Windows בקוד פתוח שיכולה להריץ תוכניות Windows ישירות על כל שולחן עבודה של לינוקס. בעיקרו של דבר, Wine מנסה להטמיע מחדש מספיק של Windows מאפס כדי שהוא יוכל להריץ את כל יישומי Windows מבלי להזדקק ל-Windows.
בצילומי מסך
Ad
בונה פיגומים
תיאור
Scaffold_builder היא תוכנה להזמנת קונטיגים שנוצרו על ידי רצף טיוטה לאורך רצף התייחסות. הפערים מתמלאים ב-N וחפיפות קטנות מיושרות עם אלגוריתם Needleman–Wunsch והקונצנזוס שנוצר עם קודי IUPAC. Scaffold_builder יכול לעזור בהרכבה וביאור של גנומים על ידי חשיפת מה שחסר ומאפשרת רצף ממוקד לסגור את הפערים הללו.(ג) Silva GG, Dutilh BE, Matthews TD, Elkins K, Schmieder R, Dinsdale EA, Edwards RA.
נא לצטט: "שילוב דה נובו והרכבה מונחית עיון עם Scaffold_builder", קוד מקור לביולוגיה ורפואה 2013.
תכונות
- גרדום
- טיוטת גנום
- ביואינפורמטיקה
ממשק משתמש
מבוסס אינטרנט, שורת פקודה
שפת תכנות
פיתון
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/scaffold-b/. זה התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
