これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなど、複数の無料オンライン ワークステーションのいずれかを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド bp_tree2pagp です。
プログラム:
NAME
bp_tree2pag - Bio::TreeIO 解析可能な形式のツリーを pagel 形式に変換します
SYNOPSIS
bp_tree2pag -if nexus -i file.nexus > file.pag
# OR パイプで STDIN を使用し、代わりに newick 形式を使用します
猫ファイル.newic | bp_tree2pag -if newick > file.nh
# OR 出力と入力を指定
bp_tree2pag -o file.pag -i file.newick
DESCRIPTION
TreeIO 解析可能ファイルを Pagel 形式のツリー ファイルに変換します。 pagel形式に注意してください
ファイルごとにXNUMXつのツリーのみを実際にサポートしているためです。 また、Pagel 解析はまだ利用できません
バイオパールで。
onworks.net サービスを使用して bp_tree2pagp をオンラインで使用する