これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windowsオンラインエミュレーター、MACOSオンラインエミュレーターなどの複数の無料オンラインワークステーションのXNUMXつを使用してOnWorks無料ホスティングプロバイダーで実行できるコマンドcmconvertです。
プログラム：
NAME
cmconvert-地獄の共分散モデルファイルを変換します
SYNOPSIS
cm変換 [オプション]
DESCRIPTION
当学校区の cm変換 ユーティリティは、入力共分散モデルファイルを別のInfernalに変換します
フォーマット。
デフォルトでは、入力CMファイルはInfernalバージョン1.0以降で作成された任意のCMファイルにすることができます。
出力CMファイルは現在のInfernal形式です。 バージョンより古いバージョンのファイル
1.0は変換できません。
'-'（ダッシュ）の場合があります。これは、この入力をから読み取ることを意味します。 stdin ファイルではなく。
OPTIONS
-h ヘルプ; コマンドラインの使用法と利用可能なすべてのオプションの簡単なリマインダーを印刷します。
-a プロファイルをASCIIテキスト形式で出力します。 これがデフォルトです。
-b プロファイルをバイナリ形式で出力します。
-1 従来のInfernal1（Infernal v1.0からv1.0.2）ASCIIテキスト形式で出力します。 のため
バージョンv1.0.2とv1.1の間の重要な変更、E値統計パラメータ
によって計算されます cmキャリブレーション in 変換された出力には書き込まれません
ファイルにソフトウェアを指定する必要があります。
--mlhmm
CMファイルを出力しないでください。 代わりに、から構築された7つの最尤pXNUMXHMMを出力します。
の各CM HMMER3ASCIIテキスト形式。 HMMが構築されます
二次構造をモデル化せずに、CMと可能な限り類似するようにします。 この
オプションは、InfernalとHMMER3の比較研究に役立つ可能性があります。
--うーん CMファイルを出力しないでください。 代わりに、各CMのフィルターp7HMMを出力します。
HMMER3ASCIIテキスト形式。
onworks.netサービスを使用してオンラインでcmconvertを使用する
