これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド dbSwiss です。
プログラム：
NAME
dbSwiss - Swiss-Prot データの DBM バージョンを作成します
SYNOPSIS
/usr/share/librg-utils-perl/dbSwiss [オプション]
/usr/share/librg-utils-perl/dbSwiss --datadir /data/swissprot --infile
/data/swissprot/uniprot_sprot.dat
/usr/share/librg-utils-perl/dbSwiss [--help] [--man]
DESCRIPTION
dbSwiss は、Swiss-Prot データの DBM バージョンを作成します。 この手順は交換するものです
スプリットスイス.pl。 SplitSwiss.pl は、Swiss-Prot レコードを別のファイルに保存するため、
13 万の比較的小さなファイルで、作成と再同期に非常に時間がかかります。 代わりにdbSwiss
各レコードを、高速に取得できるように最適化された DBM データベースに保存します。
OPTIONS
-d、--datadir=path
データベース ファイルのディレクトリ、デフォルト: '/mnt/project/rost_db/data/swissprot'
- デバッグ
--nodebug
--最初の20
--nofirst20
デバッグのために最初の 20 レコードのみを処理します
- 助けて
-i、--infile=path
Swiss-Prot データ フラットファイル、デフォルト:
「/mnt/project/rost_db/data/swissprot/uniprot_sprot.dat」。
- 男
- 静かな
--noquiet
進行状況を印刷しない
- 読み返す
--noreadback
保存後にレコードを読み取って印刷する
- テーブル
データベース テーブルの名前、したがってデータベース ファイルのベース名、デフォルト:
「デスイス」
- バージョン
-w、--workdir=path
オプションの作業ディレクトリ。 定義されていない場合は自動的に作成および削除されます。
onworks.net サービスを使用してオンラインで dbSwiss を使用する
