これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド dinifti です。
プログラム：
NAME
dinifti - DICOM ファイルを NIfTI 形式に変換します
SYNOPSIS
ディニフティ [オプション] <DICOM 入力> <ニフティ 出力>
DESCRIPTION
ディニフティ 単一または複数のファイルを一度に NIfTI データ形式に変換します。 DICOM
入力は、単一のファイル名、ファイルのリスト、またはディレクトリとして指定できます。 の場合
ディレクトリ このディレクトリ内のすべてのファイルが変換されます。
同じ録画シリーズに属する画像は、適切に XNUMX つの画像にマージされます。
3D または 4D NIfTI ファイル。 これを達成するには ディニフティ 時点の数と数値を収集します
DICOM ヘッダーからのボリュームあたりのスライスの数。 それが不可能なときは、 ディニフティ を発行します
警告 (つまり、ボリュームごとに 1 つのスライスと 1 つのタイムポイントしか見つからない場合)。 ユーザーが持っているのは、
を使用してプログラムを実行するオプション -s オプションを使用して、あたりのスライス数を指定します。
ボリューム。
Siemens Shadow セットから多数のアイテムが取得されます。 以下はアイテムのリストです
Siemens でない場合はデフォルト値。
数 of グループヘッド: 1
数 of チャンネル: 1
矢状、 コロナル 横の 位置: DICOM (0020,0032) より
OPTIONS
-g NIfTI ファイルは圧縮されます。
-f [a2|n2|n1]
出力ファイル形式を設定します。 に設定されている場合 a2 ANALYZE 7.5 ファイルペア (hdr/img) は次のようになります。
生成します。 設定 n2 引き起こすだろう ディニフティ NIfTI イメージ ファイル ペアを生成します。 の
デフォルトの出力形式 (n1) は単一の NIfTI ファイル (ヘッダーと画像データが結合されたもの)
XNUMX つのファイルにまとめられます)。
-d 設定されている場合 ディニフティ DICOM ヘッダーから出力にシリーズの説明を追加します
ファイル名。
XNUMX つの画像シリーズが共通の説明を共有している場合 ディニフティ いくつでも追加します
必要に応じて XNUMX 番目のシリーズの説明に文字を追加して、独自の説明を作成します。
ファイル名。 この場合、古いものと古いものを示す警告メッセージが表示されます。
変更されたファイル名。
--name= 」
出力ファイル名を次のようにフォーマットします。 文字列、これ 持っています 〜へ be 同封
in 引用 （ "）
形式は通常の printf のような方法で解釈されます。 普通のキャラクターは、
直接コピーした場合、パーセント記号は %% で表され、それ以外の場合、% は
変換。 当学校区の 特別 文字 "/" is 翻訳 〜へ 「〜」 〜へ 避ける 混乱
ディレクトリにジョブを開始します。 セパレータ。
If - 名前 is 現在、 -d フラグ 意志 be 無視されます。
%I サブジェクトID
%N 件名
%S 相対シリーズ番号
%D シリーズ説明
%Y シリーズの日付 (YYYYMMDD)
%T シリーズ時間 (HHMM)
%A 受入番号
%C 画像コメント
例： --name="%Y:%T- %A - %I -%D(%S)"
-s # このオプションは、ボリューム内のスライスの数を指定するために使用できます。 ディニフティ
正しい値の自動検出に失敗します。
-v, -詳細
詳細なステータス メッセージを有効にします。 警告メッセージが表示された場合、このオプションは次のようになります。
どの画像シリーズが原因かを特定するのに役立ちます。
-n, --ノアクト
設定されている場合、dinifti はすべての処理ステップを実行しますが、NIfTI ファイルは書き込みません。
終わり。 これは、DICOM ディレクトリの内容をすばやく検査するのに役立ちます (
一緒に走った -詳細).
-h, - 助けて
このヘルプ ページを印刷して終了します。
-V, - バージョン
バージョン番号を出力して終了します。
onworks.net サービスを使用してオンラインで dinifti を使用する
