これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド ecogrep です。
プログラム：
NAME
ecogrep - 分類 ID フィルターと正規表現に基づいて EcoPCR 結果をフィルタリングする
パターン
SYNOPSIS
エコグレップ [オプション] ファイル名
DESCRIPTION
ecoPCR は、LECA と Helix-Project によって開発された電子 PCR ソフトウェアです。 役に立ちます
バーコードプライマーの品質を推定します。
このプログラムは exoPCR パッケージに属します。
OPTIONS
-1 : [FIRST] : 指定されたパターンをダイレクト鎖オリゴヌクレオチドと比較します。
-2 : [SECOND] : 指定されたパターンを逆鎖オリゴヌクレオチドと比較します。
-d : [D]分類情報を含むデータベース
-e : [E]rrors : パターン一致で許容される最大エラー (オプション 1、 -2 & -p) (0までに
デフォルト）
-p : [P]パターン : オリゴヌクレオチドパターン
-h : [H]ヘルプ: 印刷ヘルプ
-i : [I] 指定された分類 ID の下のサブツリーを無視します
-r : [制限] 指定された分類 ID の下のサブツリーに検索を制限します
-v : 一致の感覚を[V]変換して、一致しない行を選択します。
引数：
ecoPCR 出力ファイル名
onworks.net サービスを使用してオンラインで ecogrep を使用する
