これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windowsオンラインエミュレーター、MACOSオンラインエミュレーターなどの複数の無料オンラインワークステーションのXNUMXつを使用してOnWorks無料ホスティングプロバイダーで実行できるコマンドfslです。
プログラム：
NAME
fsl-FMRI、MRI、DTI脳イメージング用の分析ツール
DESCRIPTION
FSL は、医用脳画像データを分析するための包括的なツールキットです。 それ
データ前処理、脳抽出、画像レジストレーション、および
幅広い統計分析。 FSL 使いやすいGUIを提供します。
FSL いくつかの環境変数を適切に設定する必要があります。 これを達成するために、
/etc/fsl/5.0/fsl.shから構成スクリプトを入手してください。 これを行うXNUMXつの方法
自動的にを含む行を追加することです
。 /etc/fsl/5.0/fsl.sh
ユーザーのホームディレクトリの.bashrcファイル（または他のシェルの対応するファイル）
bashより）。 最初にそのようなファイルを作成する必要があるかもしれません。
または、Debianパッケージは、のすべてのFSLツールのシンボリックリンクをインストールします。 / usr / bin それ
適切な構成を自動的にロードするように注意してください。 シンボリックリンク名は
対応する接頭辞 FSL ファイル名の競合を防ぎ、許可するバージョン
同じシステム上に共存する複数のバージョン。 たとえば、 スライサー コマンドは
として利用可能 fsl5.0-スライサー。 ご使用の際はご注意ください FSL これらのシンボリックリンクを介したツールは
上記のセットアップ手順を実行するために必要です。 しかし、この便利さ
機能はDebian固有です。 FSLコマンドを使用し、共有することを目的としたスクリプト
他の人と一緒に、接頭辞のないコマンド名とFSL環境変数に依存する必要があります
セットアップ。
FSL ユーザーインターフェイスは時々参照します FSLDIR。 Debianシステムでは、これは
/usr/share/fsl/5.0 FSLバージョン5.0の場合。
FSL ドキュメントとオンラインヘルプは、 fsl-5.0-doc パッケージ。
の使用法に関する質問 FSL または関連する理論はに投稿することができます FSL 郵送
リスト （参照してください http://www.jiscmail.ac.uk/lists/fsl.html).
並列化
FSLは、実行中のSun Gridengine（SGE）にジョブを送信するように構成できます。 すべてではありませんが
FSLに実装された機能は、この種の並列化をサポートします。これは最も要求の厳しいものです。
処理ツール（POSSUMやFDTなど）はそうします。
FSLは、SGE_ROOT環境変数が設定されていない場合でも、次のようにSGEを使用できる必要があります。
SGEのDebianパッケージの場合。 バッチ処理を有効にするには、
FSLPARALLEL = 1
FSLが実行されているシェル内。 これはで恒久的に有効にすることができます
/etc/fsl/5.0/fsl.sh
またはケースバイケースで。
onworks.netサービスを使用してオンラインでfslを使用する
