これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド gbrowse です。
プログラム：
NAME
GBrowse2 - 汎用ゲノムブラウザ
SYNOPSIS
libgbrowse-perl [-NS]
インストール
Apache2 がシステムにインストールされている場合、ソフトウェアは URL を
Gディレクトリを参照します。 これを考慮するには、Apache を再起動する必要があります。
設定は /etc/gbrowse2/apache2.conf ファイルで利用できます。
別の Web サーバーを使用する場合は、apache2 テンプレートを参照して URL をマップする必要があります。
同じ方法。
依存関係
追加機能を提供するために、追加のオプションの Perl 依存関係が存在します。 ご参照ください
詳細については、INSTALL ファイルのオプション モジュールを参照してください。
CONFIGURATION
gbrowse2 設定ファイルは /etc/gbrowse にあります。 主な設定ファイルは
GBrowse.conf。 これには、グローバル構成要素が含まれています。 特定の構成ファイル
データバンクごとに同じディレクトリにあります。 詳細については、以下を参照してください。
Gドキュメントを参照します。
インストールには酵母ゲノム サンプルが付属しています。
DESCRIPTION
GBrowse はシンプルですが高度な機能を備えています
構成可能な Web ベースのゲノム ブラウザー。 のコンポーネントです。
ジェネリック モデル生物システム データベース プロジェクト (GMOD)。
その機能のいくつか：
* ゲノムの鳥瞰図と詳細図を同時に表示。
* スクロール、ズーム、中央揃え;
* 任意の URL を注釈に添付します。
* トラックの順序と外観は管理者がカスタマイズでき、
エンドユーザー;
* アノテーション ID、名前、またはコメントで検索します。
* GFF 形式を使用したサードパーティの注釈をサポートします。
* 設定はセッション間で保持されます。
* DNA および GFF ダンプ;
* BioSQL や Chado などのさまざまなデータベースへの接続。
* 多言語サポート;
* サードパーティ機能の読み込み;
* カスタマイズ可能なプラグイン アーキテクチャ (例: BLAST の実行、ダンプ、インポートなど)
フォーマット、オリゴヌクレオチドの検索、プライマーの設計、制限マップの作成、
編集機能)。
WEB ACCESS
GBrowse には URL からアクセスできます http://localhost/gbrowse2
onworks.net サービスを使用してオンラインで gbrowse を使用する
