これは gmod_fasta2gff3.plp コマンドで、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できます。
プログラム:
NAME
$O - FASTA を単純な GFF3 に変換します
シノプシス
% $O [オプション]
コマンドライン OPTIONS
--fasta_dir fasta ファイルが含まれるディレクトリ
(デフォルト: ./fasta)
--gfffilename 作成する GFF3 ファイルの名前
(デフォルト: ./out.gff)
--type 各機能に割り当てる SO タイプ
(デフォルト:EST)
--source ソース列に表示するテキスト
(デフォルト: 。)
--attributes 列 9 に表示される追加の tag=value ペア
--nosequence ##FASTA セクションを抑制します (つまり、
DNA 配列を印刷)
DESCRIPTION
このスクリプトは、fasta ファイルのコレクションを取得し、単純な GFF3 に変換するだけです。
茶道への積み込みに適しています。
作者
スコット・ケイン[メール保護]>
著作権(c)2006
このライブラリはフリー ソフトウェアです。 同じ方法で再配布したり変更したりできます。
Perl自体としての用語。
onworks.net サービスを使用してオンラインで gmod_fasta2gff3.plp を使用する