これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド gt-encseq-decode です。
プログラム：
NAME
gt-encseq-decode - エンコードされたシーケンスをデコード/抽出します。
SYNOPSIS
gt エンセック デコード (シーケンスファイル|インデックス名)
DESCRIPTION
-ミラーリングされた [はい|いいえ]
各シーケンスの逆補数を仮想的に追加します (デフォルト: no)
-無損失の [はい|いいえ]
ロスレスのオリジナル シーケンスの取得を許可します (デフォルト: いいえ)
-dir [文字列]
読み取り方向を指定します (fwd、cpl、rev、rcl) (デフォルト: fwd)
-singlechars [はい|いいえ]
GtEncseqReader を使用せず、各シーケンス文字に個別にアクセスします (デフォルト:
いいえ）
-seq [値]
番号で識別される抽出シーケンス (デフォルト: 未定義)
-seqrange [start end]
複数の連続するシーケンスを抽出します (デフォルト: 未定義)
-出力 [...]
出力形式を指定します (fasta|concat から選択) (デフォルト: fasta)
-範囲 [start end]
抽出する連結範囲 (暗黙的に -出力 連結) (デフォルト: 未定義)
-セプチャー [文字列]
SEPARATOR として印刷する文字を指定します (デフォルト: |)
-助けて
基本オプションのヘルプを表示して終了します
-ヘルプ+
すべてのオプションのヘルプを表示して終了します
-バージョン
バージョン情報を表示して終了します
報告 バグ
バグを報告する[メール保護]>.
onworks.net サービスを使用して gt-encseq-decode をオンラインで使用する
