これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなど、複数の無料オンライン ワークステーションのいずれかを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド gt-gff3validator です。
プログラム:
NAME
gt-gff3validator - 指定された GFF3 ファイルを厳密に検証します.
SYNOPSIS
gt gff3検証者 [オプション...] [GFF3_file ...]
DESCRIPTION
-タイプチェック [文字列]
OBO ファイルで指定されたオントロジーを使用して親子関係を検証します。 いいえの場合
引数が指定されている場合は、gtdata/obo_files ディレクトリのソファ.obo ファイルが使用されます。 もし
引数が指定されている場合、それは OBO ファイル名として使用されます。 そのようなファイルが存在する場合
存在しない .obo が引数に追加され、結果のファイル名が
gtdata/obo_files ディレクトリが試行されます。 (デフォルト: 未定義)
-xrfcheck [文字列]
Dbxref および Ontology_term 属性をチェックして、正しい構文に従ってください。
略語定義ファイル。 引数が指定されていない場合は、
gtdata/xrf_abbr ディレクトリが使用されます。 引数が与えられた場合、それは特定の引数として使用されます
略語ファイルのファイル名。 そのようなファイルが存在しない場合、
.xrf_abbr が引数に追加され、結果のファイル名が
gtdata/xrf_abbr ディレクトリが試行されます。 (デフォルト: 未定義)
-助けて
ヘルプを表示して終了します
-バージョン
バージョン情報を表示して終了します
報告 バグ
バグを報告する[メール保護]>.
onworks.net サービスを使用してオンラインで gt-gff3validator を使用する