これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド gt-seqstat です。
プログラム:
NAME
gt-seqstat - fasta ファイルの統計を計算します。
SYNOPSIS
gt 秒統計 [オプション] ファイル [...]
DESCRIPTION
-v [はい|いいえ]
冗長にする(デフォルト:いいえ)
-ディストレン [はい|いいえ]
シーケンス長の分布を表示 (デフォルト: no)
-b [値]
distlen オプションのバケット サイズ (デフォルト: 100)
-バイナリ [はい|いいえ]
distlen 出力の出力ファイル名にはバイナリ形式を使用します。 .distlen
バケットサイズ: 1 (デフォルト: いいえ)
-コンティグ [はい|いいえ]
コンティグセット統計の概要 (デフォルト: はい)
-ストレッチ [はい|いいえ]
A 部分文字列の分布を表示 (デフォルト: no)
-ゲノム [値]
NG50/NG80 計算用のゲノム長を設定します (デフォルト: 0)
-助けて
基本オプションのヘルプを表示して終了します
-ヘルプ+
すべてのオプションのヘルプを表示して終了します
-バージョン
バージョン情報を表示して終了します
報告 バグ
バグを報告する[メール保護]>.
onworks.net サービスを使用して gt-seqstat をオンラインで使用する