これはコマンド kmc_tools-kmers_subtract で、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks の無料ホスティング プロバイダーで実行できます。
プログラム：
NAME
kmc_tools-kmers_subtract - XNUMX つの KMC データベースの減算を計算します。
SYNOPSIS
kmc_tools kmers_subtract <output
[出力パラメータ]>
DESCRIPTION
出力データベースには、最初の入力セットに存在する k-mer のみが含まれますが、
XNUMX本目では欠席。 カウンタ値は最初の入力からの値と等しい
設定します。
OPTIONS
各入力には追加のパラメーターがあります。
-ci
以下に出現するk-merを除外する回
-cx
以下に多く存在するk-merを除外する回
出力には追加のパラメーターがあります。
-ci
以下に出現するk-merを除外する回
-cx
以下に多く存在するk-merを除外する回
-cs
カウンタの最大値
実施例
kmc -k28 file1.fastq kmers1 tmp
kmc -k28 file2.fastq kmers2 tmp
kmc_tools kmers_subtract kmers1 kmers2 kmers1_kmers2_subtract -cs200
onworks.net サービスを使用してオンラインで kmc_tools-kmers_subtract を使用する
