これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド lastdb です。
プログラム：
NAME
lastdb - 生物学的配列のゲノムスケールの比較
SYNOPSIS
最後のデータベース [オプション] 出力名 fasta シーケンス ファイル
DESCRIPTION
その後の lastal とのアラインメントのために配列を準備します。
OPTIONS
メイン オプション
-h, - 助けて
すべてのオプションとそのデフォルト設定を表示して終了します
-p 配列をタンパク質として解釈する
-R 繰り返しマーキング オプション (デフォルト = 10)
-c ソフトマスクの小文字
高機能 オプション （デフォルト 設定）
-Q 入力形式: 0=fasta、1=fastq-sanger、2=fastq-solexa、3=fastq-illumina (0)
-s ボリュームサイズ (無制限)
-m シードパターン（非DNA：1）
-u シードスキーム (DNA: YASS)
-w インデックスステップ (1)
-a ユーザー定義のアルファベット
-i クエリ位置ごとの初期一致の最小制限 (0)
-b バケットの深さ
-C 子テーブルのタイプ: 0=なし、1=バイトサイズ、2=ショートサイズ、3=フル (0)
-x シーケンスと文字を数えるだけです
-v 冗長にする: lastdb が何をしているのかについてのメッセージを書きます。
-V, - バージョン
バージョン情報を表示して終了します
報告 バグ
バグの報告先： [メール保護]
最後のホームページ: http://last.cbrc.jp/
onworks.net サービスを使用して、オンラインで lastdb を使用する
