これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなど、複数の無料オンライン ワークステーションのいずれかを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド ltrsift です。
プログラム：
NAME
ltrsift - LTR の後処理と分類のためのグラフィカル インターフェイス
レトロトランスポゾン候補
SYNOPSIS
シフト
DESCRIPTION
LTRsift は、de novo 予測の半自動後処理用のグラフィカル デスクトップ ツールです。
LTRharvest や LTRdigest によって生成されたものなど、LTR レトロトランスポゾン アノテーション。
CONFIGURATION
LAST バイナリ (lastal および lastdb) は、システム検索パスに配置する必要があります。 もし彼らが
「GT_LAST_PATH」環境を使用してその場所を指定することは可能ですか?
LTRsift を実行する前の変数。 同じことがBLASTの場所にも当てはまります。 使用
「GT_BLAST_PATH」は、「blastall」実行可能ファイルへのフルパスを指定します。
スタイル ファイル (候補フィーチャの線形図がどのように見えるかを記述) は、
LTRSIFT_STYLE_FILE 環境変数で設定します。 賢明なデフォルトスタイルが構築されています
LTRシフトに。
onworks.net サービスを使用してオンラインで ltrsift を使用する
