これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド makemat です。
プログラム:
NAME
makemat - バイナリプロファイルを移植可能な ASCII 形式に変換します
SYNOPSIS
メイクマット [-] [-E N] [-G N] [-H] [-P ファイル名] [-S X] [-U STR] [-d STR] [-z N]
DESCRIPTION
メイクマット によって作成されたバイナリ プロファイルのコレクションを変換します。 -C PSI-BLASTのオプション、
移植可能な ASCII 形式に変換します。
OPTIONS
オプションの概要は以下に含まれています。
- 使用状況メッセージを印刷する
-E N ギャップを拡張するためのコスト (デフォルト = 1)
-G N ギャップを開くためのコスト (デフォルト = 11)
-H ヘルプを印刷します。 他のすべての引数をオーバーライドします
-P ファイル名
プロファイル データベースのデータベース名 (デフォルト = stdin)
-S X 丸めの問題を回避するための行列出力のスケーリング係数 (デフォルト = 100)
-U STR 基礎となる行列 (デフォルト = ブロッサム62)
-d STR プロファイルの作成に使用される基礎となる配列データベース (デフォルト = nr)
-z N プロファイル データベースの有効長 (長さの場合は 0) -d オプション)
onworks.net サービスを使用してオンラインで makemat を使用する
