これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド MapMers です。
プログラム:
NAME
mapMers - kmers をシーケンスにマッピングする統計をレポートします。
SYNOPSIS
マップマーズ {-統計|-地域|-詳細} -m マーサイズ -マーズ マー -seq ファスタ
OPTIONS
-統計 各シーケンスの平均、最小、最大を log2 とともにレポートします。
カウントのヒストグラム
-地域
kmer をカバーする地域をレポートします
-詳細
シーケンス内の各 kmer のデータベース内の順方向カウントと逆方向カウントをレポートします。
-m マーサイズ
-マーズ マー
メリル(1)データベース
-seq ファスタ
入力シーケンスファイル
onworks.net サービスを使用してオンラインで MapMers を使用する