これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windowsオンラインエミュレーター、MACOSオンラインエミュレーターなどの複数の無料オンラインワークステーションのXNUMXつを使用してOnWorks無料ホスティングプロバイダーで実行できるコマンドmasai_indexerです。
プログラム:
NAME
masai_indexer-マサイインデクサー
SYNOPSIS
masai_indexer[オプション]
DESCRIPTION
マサイ族は、おおよそのシードと複数のシードに基づく高速で正確な読み取りマッパーです。
バックトラック。
見る http://www.seqan.de/projects/masai 。
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-h, - 助けて
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- バージョン
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ゲノムインデックスオプション:
-x, - 索引 STR
ゲノムインデックスタイプを選択します。 esa、sa、qgram、およびfmのいずれか。 デフォルト:sa。
-XP, --インデックスプレフィックス STR
ゲノムインデックスプレフィックス名を指定します。 デフォルト:ゲノムファイル名プレフィックスを使用します。
出力オプション:
-t, --tmp フォルダー STR
巨大な一時フォルダを指定します。 デフォルト:ゲノムフォルダーを使用します。
VERSION
masai_indexerバージョン:0.7.1[14053]最終更新日2013-05-16
onworks.netサービスを使用してオンラインでmasai_indexerを使用する