これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド mbfa-mpi です。
プログラム：
NAME
mbfa - Murasaki Binary FASTA フォーマットコンバーター
SYNOPSIS
mbfa [オプション...] [入力] [入力2 ...] # [入力] と [入力2 ...] を Muraaski バイナリ FASTA ファイルに変換します
説明
Murasaki は、各塩基が次のように表現される 2 ビット形式を使用して配列データを処理します。
2ビット。 同様のことを行う既存の形式が多数ありますが、
特に紫は2文字では表現しきれないメタデータを知っておく必要がある
ビット (例: NNNN のシーケンスが存在する場合、複数のシーケンスが存在する場合、シーケンスは中断されます)
FASTA ファイルなどに含まれているため)、MBFA 形式にはこのデータも含まれます。
通常、これらのファイルは、新しいコンピュータで最初に実行するときに Murasaki によって自動的に生成されます。
シーケンス。
ファイル形式は紫に合わせて設計されているため、実際のファイル拡張子は
アーキテクチャを反映して変わります。 通常は、.mbfa[48][48] の何らかの形式になります。
(例: ".mbfa88" (amd64 上のデフォルトの gcc ビルド))。
OPTIONS
--info|-i
指定された各 MBFA に関するメタデータを表示します。
--force|-f
デフォルトでは ムファ すでに最新の .mbfa ファイルがあるファイルはスキップされます。 このオプション
これらのファイルを強制的に再生成します。
--致命的|-F
エラーは致命的になります。 通常、複数のファイルを指定すると、mbfa は変換を試みます。
たとえ XNUMX つが警告を発せなかったとしても、それらはすべてです。 --fatal を指定すると停止して終了します
問題がある場合はエラーが表示されます。
--fasta|-A
MBFA データに基づいて対応する FASTA 出力を標準出力に生成します。
--help|-h、--version|-V、--verbose|-V
ご想像の通り。
onworks.net サービスを使用してオンラインで mbfa-mpi を使用する
