これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks の無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド mcmc_analysis です。
プログラム：
NAME
mcmc_analysis - MCMC の分析
SYNOPSIS
mcmc_分析 [OPTIONS] MCMC-データ ...
DESCRIPTION
このプログラムは、BEEP 内のプログラムから XNUMX つまたは複数のファイルから MCMC 出力を読み取ります。
パッケージ。 各入力ファイルに同じ列が存在することが重要です。
入力形式：
形式に関する MCMC の反復からの出力
コラボレー
float 形式の尤度の対数です。
フィールドを区切るタブの空白です
反復の序数を表す整数です
セミコロンで区切られたフィールドのリストです。
MCMC のパラメータ。
MCMC パラメータは、ファイルの最初の行で入力され、名前が付けられます。
フォーマット上にあるものは
#L N [ ( )]+
名前は一意である必要がありますが、そうである必要はありません。 のXNUMXであります
of
フロート
ログフロート
整数
ツリー
オーソロジーペア
残りの行を解析および分析する方法を推測するために使用されます。
出力フォーマット：
パラメーターの事後推定値を含む、MCMC 実行に関するレポート。
OPTIONS
-b [浮動小数点|整数]
対象となる入力のパーセンテージ (0 <= x <1)、または数 (x は整数 >= 1)
バーニンとして廃棄されます。 デフォルト: 0.1。
-p STRING
という名前のパラメータをプロットします。 出力は XNUMX つの列で、反復数と
反復内のパラメータの値。
-i STRING
名前付きパラメータを無視します。 列名については、MCMC 出力のヘッダー行を参照してください。 あなた
カンマ区切り形式を使用して、一度に複数の列に名前を付けることができます (例: -i
長さ、名前)。 列名の間にスペースは使用できません。
-t 分析用に LaTex を出力します。
-l 入力ファイル内のサンプル数をカウントして報告します。
-mp NT プロットするポイントの最大数。
-sp プロット内の点を明示的に示します。
-コーダ R の CODA パッケージの出力ファイル
-コーダツリー
-coda と同じですが、ツリー パラメーターが含まれます。 各ツリーは整数の ID として出力されます。
(一連の訪問順序、1,2、XNUMX、...)。 ツリーを非表示にするには、必ず -i を使用してください。
長さ/時間/料金が含まれます。
-P 平行チェーン。 これは、(並列) サンプルの複数のファイルがリストされていることを意味します。
URL
プライムフィロのホームページ： http://prime.sbc.su.se
onworks.net サービスを使用してオンラインで mcmc_analysis を使用する
